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Enregistrement W4402079077 · doi:10.1021/acs.jproteome.4c00025

Biological Sex Is an Effect Modifier of Allergen-Mediated Alteration of the Lung Proteome

2024· article· en· W4402079077 sur OpenAlexafffund
Courtney Lynn Marshall, D.H.D. Mostafa, Mahadevappa Hemshehkar, Ying Lao, Robert Balshaw, Victor Spicer, Neeloffer Mookherjee

Notice bibliographique

RevueJournal of Proteome Research · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAsthma and respiratory diseases
Établissements canadiensGeorge & Fay Yee Centre for Healthcare InnovationUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanadian Allergy, Asthma and Immunology Foundation
Mots-clésProteomeAeroallergenAsthmaAllergenImmunologyBiologySex characteristicsProteomicsLungMedicineAllergyBioinformaticsInternal medicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Asthma exhibits a distinct sex bias in the disease prevalence, severity, and response to therapy. However, sex-related differences in alterations of the lung proteome mediated by aeroallergens critical in asthma, such as house dust mites (HDM), remain unknown. In this study, we define sex-related differences in the lung proteome using an HDM-challenged mouse model by 1D LC-MS/MS. Sex-disaggregated data analysis showed that 406 proteins were uniquely altered in females, 273 proteins were uniquely altered in males, and 414 proteins were altered in both females and males in response to HDM. In a linear mixed model analysis, sex modified the HDM exposure effect for 163 proteins, i.e., a significant sex:exposure interaction was identified in 84 proteins in females and 35 proteins in males. Of these, 12 proteins showed a significant sex effect in both female and male lungs. We further selected 3 proteins Tjp1, Lamtor1, and G3BP2 for independent confirmation studies. Our findings detail the sex-specific lung proteome in response to an aeroallergen critical in asthma and demonstrate that sex is a significant effect modifier of HDM response. These results will serve as a valuable resource for delineating sex-specific mechanisms in aeroallergen-driven responses in asthma research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,085
Tête enseignante GPT0,421
Écart entre enseignants0,335 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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