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Enregistrement W4402087810 · doi:10.22541/au.172512280.07521491/v1

Fish Allergenicity Ladder and Parvalbumin Epitopes for Predicting Clinical Cross-reactivity and Reintroduction

2024· preprint· en· W4402087810 sur OpenAlexaff
Christine Wai, Nicki Y.H. Leung, Agnes Sze Yin Leung, Man Tang, Asa Marknell-DeWitt, Jaime S. Rosa Duque, Gilbert T. Chua, Yat Sun Yau, Wai Hung Chan, Po K. Ho, Mike Kwan YW, Qun U. Lee, Joshua Sung Chih Wong, Ivan C.S. Lam, James W. C. H. Cheng, David Luk, Zhongyi Liu, Noelle Anne Ngai, Oi Man Chan, Patrick S.C. Leung, Gary Wong, Ting Fan Leung

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFood Allergy and Anaphylaxis Research
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesHealth and Medical Research Fund
Mots-clésParvalbuminFish <Actinopterygii>EpitopeCross-reactivityZoologyReactivity (psychology)BiologyCross reactionsFisheryImmunologyMedicineAntibodyGeneticsPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

not-yet-known not-yet-known not-yet-known unknown Background: IgE-mediated fish allergy has long been considered an umbrella term due to the high cross-reactivity of parvalbumin, the major fish allergen. Yet, clinical tolerance to certain fish highlights allergenicity differences. In this study, we sought to construct a fish allergenicity ladder and identify fish parvalbumin epitopes to improve the diagnosis of fish allergy. Methods: Reported clinical history and the serum-specific IgE (sIgE) responses of 200 fish allergic patients were collected and analyzed, while the relative parvalbumin content in different fish were measured for the construction of fish allergenicity ladder. Double-blind placebo-controlled food challenge (DBPCFC) and open challenge against salmon, grass carp and grouper were performed in 58 selected patients for validation of the ladder. Epitope mapping was performed by peptide array against parvalbumins of salmon (both β-1 and β-2), cod, grouper, and grass carp with sera from fish allergic (n=11), partial fish tolerant (n=12), and complete fish tolerant (n=5) patients diagnosed based on oral food challenge outcome. Results: The distribution pattern of clinical, sIgE and molecular data and their strong positive correlation led to the construction of a 4-step fish allergenicity ladder comprising: step 1 of the least allergenic fishes (tuna, halibut, salmon), steps 2 (cod) and 3 (herring and grouper) of moderately allergenic fishes to step 4 of highly allergenic fishes (catfish, grass carp and tilapia). Epitope mapping revealed one epitope from grouper parvalbumin (AA64-78) for diagnosing general fish allergy and one epitopic region from salmon parvalbumin (AA19-33) as biomarker of specific fish tolerance. Only epitope-specific IgE differentiated these patients but not sIgE to fish extract or parvalbumin. Conclusion: The fish ladder and epitopes discovery can precisely differentiate fish-allergic and tolerant subjects and guide fish reintroduction by stepping up the ladder, which innovate fish allergy care in the next millennium.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,066
Tête enseignante GPT0,414
Écart entre enseignants0,347 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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