VEMcomp: a Virtual Elements MATLAB package for bulk-surface PDEs in 2D and 3D
Notice bibliographique
Résumé
Abstract We present a Virtual Element MATLAB solver for elliptic and parabolic, linear and semilinear Partial Differential Equations (PDEs) in two and three space dimensions, which is coined VEMcomp. Such PDEs are widely applicable to describing problems in material sciences, engineering, cellular and developmental biology, among many other applications. The library covers linear and nonlinear models posed on different simple and complex geometries, involving time-dependent bulk, surface, and bulk-surface PDEs. The solver employs the Virtual Element Method (VEM) of lowest polynomial order $${k=1}$$ k = 1 on general polygonal and polyhedral meshes, including the Finite Element Method (FEM) of order $${k=1}$$ k = 1 as a special case when the considered mesh is simplicial. VEMcomp has three main purposes. First, VEMcomp generates polygonal and polyhedral meshes optimized for fast matrix assembly. Triangular and tetrahedral meshes are encompassed as special cases. For surface PDEs, VEMcomp is compatible with the well-known Matlab package DistMesh for mesh generation. Second, given a mesh for the considered geometry, possibly generated with an external package, VEMcomp computes all the matrices (mass and stiffness) required by the VEM or FEM method. Third, for multiple classes of stationary and time-dependent bulk, surface and bulk-surface PDEs, VEMcomp solves the considered PDE problem with the VEM or FEM in space and IMEX Euler in time, through a user-friendly interface. As an optional post-processing, VEMcomp comes with its own functions for plotting the numerical solutions and evaluating the error when possible. An extensive set of examples illustrates the usage of the library.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,075 | 0,024 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».