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Enregistrement W4402103716 · doi:10.18502/ijpa.v19i3.16387

A New Immunogenic Structure of Polyepitopic Fusion against Leishmania major: In Silico Study

2024· article· en· W4402103716 sur OpenAlexaff
Saeed Pirmoradi, Mohammad Darvish Khadem, Zohre Monjezi, Somayeh Bahrami, Chukwunonso O. Nzelu

Notice bibliographique

RevueIranian Journal of Parasitology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueResearch on Leishmaniasis Studies
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesShahid Chamran University of Ahvaz
Mots-clésAntigenEpitopeImmune systemMajor histocompatibility complexBiologyLeishmaniaLeishmaniasisCD8ImmunologyVirologyParasite hostingComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: The lack of complete protection against leishmaniasis and the challenges of anti-leishmaniasis drug treatment have made the treatment process more difficult. This study aimed to develop a new strategy for preparing a vaccine against cutaneous leishmaniasis using some of the antigenic proteins of the Leishmania parasite. Methods: This study was carried out in 2022 at Shahid Chamran University of Ahvaz, Ahvaz, Iran. After preparing suitable epitopes of the Leishmania parasite and examining their antiparasitic properties, the process of making a fusion vaccine was performed and with the help of various bioinformatics tools, physicochemical and structural properties as well as immunological and simulation properties were studied and finally optimized. Construction and cloning were performed in the E.coli K12 system and finally, the docking process was performed with Toll-like receptors (TLRs), major histocompatibility complex I (MHC-I), and MHC-II receptors. With the help of selected epitopes of the Leishmania parasite, which had a high percentage of population coverage, a stable, antigenic, and non-allergenic chimeric vaccine was predicted. Results: The results of the structural analysis of the TLR5\vaccine complex and simulation of its molecular dynamics showed a sufficiently stable binding. It also showed good potential for stimulation and production of active B cells and memory, as well as the potential for CD8+ T, CD4+ T cell production and development of Th2 and Th1-induced immune responses. Conclusion: Computational results showed that the designed immunogenic structure has the potential to adequately stimulate cellular and humoral immune responses against Leishmania parasitic disease. As a result of evaluating the effectiveness of the candidate vaccine through in vivo and in vitro immunological tests, it can be suggested as a vaccine against Leishmania major.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,235
Score d'incertitude au seuil0,715

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,347
Écart entre enseignants0,329 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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