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Enregistrement W4402147368 · doi:10.3899/jrheum.2024-0519

Clustering Methods in Rheumatic and Musculoskeletal Disease Research: An Educational Guide to Best Research Practices

2024· review· en· W4402147368 sur OpenAlexvenueno aff
Jamie E. Collins

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Rheumatology · 2024
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRheumatoid Arthritis Research and Therapies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin Diseases
Mots-clésCluster analysisMedicineDiseaseData scienceConsensus clusteringRheumatic diseaseCluster (spacecraft)Artificial intelligenceInternal medicineFuzzy clusteringComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Clinical manifestations and disease progression often exhibit significant variability among patients with rheumatic diseases, complicating diagnosis and treatment strategies. A better understanding of disease heterogeneity may allow for personalized treatment strategies. Cluster analysis is a class of statistical methods that aims to identify subgroups or patterns within a dataset. Cluster analysis is a type of unsupervised learning, meaning there are no outcomes or labels to guide the analysis (ie, there is no ground truth). This makes it difficult to assess the accuracy or validity of the identified clusters, and these methods therefore require thoughtful planning and careful interpretation. Here, we provide a high-level overview of clustering, including different types of clustering methods and important considerations when undertaking clustering, and review some examples from the rheumatology literature.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,028
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,055
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,972
Score d'incertitude au seuil0,146

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0280,055
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,003
Méta-épidémiologie (sens large)0,0050,004
Bibliométrie0,0170,015
Études des sciences et des technologies0,0020,005
Communication savante0,0050,007
Science ouverte0,0060,004
Intégrité de la recherche0,0060,011
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0160,021

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,263
Tête enseignante GPT0,605
Écart entre enseignants0,343 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
DomaineMéthodes
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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