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Enregistrement W4402173007 · doi:10.1016/j.vaccine.2024.126266

Immunoproteomic discovery of Mycobacterium bovis antigens, including the surface lipoprotein Mpt83 as a T cell antigen useful for vaccine development

2024· article· en· W4402173007 sur OpenAlexaff
Karuna P. Karunakaran, Hong Yu, Xiaozhou Jiang, Queenie W. T. Chan, Lynette B. Sigola, Leonard A. Millis, Jiaqi Chen, Patrick Tang, Leonard J. Foster, Robert C. Brunham

Notice bibliographique

RevueVaccine · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune responses and vaccinations
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreBC Centre for Disease ControlDouglas College
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious Diseases
Mots-clésImmunogenicityMycobacterium bovisELISPOTMHC class IAntigenMycobacterium tuberculosisVirologyMHC class IITuberculosisBiologyImmunologyMajor histocompatibility complexTuberculosis vaccinesBCG vaccineVaccinationMicrobiologyMedicineCD8

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Tuberculosis (TB) is one of the leading causes of death from infectious diseases, killing approximately 1.3 million people worldwide in 2022 alone. The current vaccine for TB contains a live attenuated bacterium, Mycobacterium bovis BCG (Bacille Calmette-Guérin). The BCG vaccine is highly effective in preventing severe forms of childhood TB but does not protect against latent infection or disease in older age groups. A new or improved BCG vaccine for prevention of pulmonary TB is urgently needed. In this study, we infected murine bone marrow derived dendritic cells from C57BL/6 mice with M. bovis BCG followed by elution and identification of BCG-derived MHC class I and class II-bound peptides using tandem mass spectrometry. We identified 1436 MHC-bound peptides of which 94 were derived from BCG. Fifty-five peptides were derived from MHC class I molecules and 39 from class II molecules. We tested the 94 peptides for their immunogenicity using IFN- γ ELISPOT assay with splenocytes purified from BCG immunized mice and 10 showed positive responses. Seven peptides were derived from MHC II and three from MHC class I. In particular, MHC class II binding peptides derived from the mycobacterial surface lipoprotein Mpt83 were highly antigenic. Further evaluations of these immunogenic BCG peptides may identify proteins useful as new TB vaccine candidates.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,204
Score d'incertitude au seuil0,855

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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