Solution-based biophysical characterization of conformation change in structure-switching aptamers
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Structure-switching aptamers have become ubiquitous in several applications, notably in analytical devices such as biosensors, due to their ease of supporting strong signaling. Aside from their ability to bind specifically with their respective target, this class of aptamers also undergoes a conformational rearrangement upon target recognition. While several well-studied and early-developed aptamers (e.g., cocaine, ATP, and thrombin) have been found to have this structure-switching property, the vast majority do not. As a result, it is common to try to engineer aptamers into switches. This proves challenging in part because of the difficulty in obtaining structural and functional information about aptamers. In response, we review various readily available biophysical characterization tools that are capable of assessing structure switching of aptamers. In doing so, we delve into the fundamentals of these different techniques and detail how they have been utilized in characterizing structure-switching aptamers. While each of these biophysical techniques alone has utility, their real power to demonstrate the occurrence of structural change with ligand binding is when multiple techniques are used. We hope that through a deeper understanding of these techniques, researchers will be better able to acquire biophysical information about their aptamer-ligand systems and accelerate the translation of aptamers into biosensors.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle