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Enregistrement W4402266268 · doi:10.1021/acs.jmedchem.4c01346

Structure Activity of β-Amidomethyl Vinyl Sulfones as Covalent Inhibitors of <i>Chikungunya</i> nsP2 Cysteine Protease with Antialphavirus Activity

2024· article· en· W4402266268 sur OpenAlexafffund
Anirban Ghoshal, Kesatebrhan Haile Asressu, Mohammad Anwar Hossain, Peter J. Brown, Meganathan Nandakumar, Anand Vala, Eric M. Merten, John D. Sears, Isabella Law, Jane Burdick, Noah L. Morales, Sumera Perveen, Kenneth H. Pearce, Konstantin Popov, Nathaniel J. Moorman, Mark T. Heise, Timothy M. Willson

Notice bibliographique

RevueJournal of Medicinal Chemistry · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMosquito-borne diseases and control
Établissements canadiensStructural Genomics ConsortiumUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesUniversity of North Carolina at Chapel HillGenentechEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsUniversity of TorontoUNC Eshelman School of Pharmacy, University of North Carolina at Chapel HillOntario Genomics InstituteMerck KGaANational Institutes of HealthOntario GenomicsGenome CanadaMcGill UniversityNorth Carolina Biotechnology CenterNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesBayerPfizerBristol-Myers Squibb
Mots-clésChemistryAlphavirusChikungunyaSulfoneCysteineCysteine proteaseCovalent bondProteaseStructure–activity relationshipEnzyme inhibitorStereochemistryBiochemistryVirologyEnzymeIn vitroVirusOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

High Resolution Image Download MS PowerPoint Slide Despite their widespread impact on human health, there are no approved drugs for combating alphavirus infections. The heterocyclic β-aminomethyl vinyl sulfone RA-0002034 ( 1a ) is a potent irreversible covalent inhibitor of the alphavirus nsP2 cysteine protease with broad-spectrum antiviral activity. Analogs of 1a that varied each of the three regions of the molecule were synthesized to establish structure–activity relationships for the inhibition of Chikungunya (CHIKV) nsP2 protease and viral replication. The vinyl sulfone covalent warhead was highly sensitive to modifications. However, alterations to the core five-membered heterocycle and aryl substituent were well tolerated. The 5-(2,5-dimethoxyphenyl)pyrazole ( 1o ) and 4-cyanopyrazole ( 8d ) analogs exhibited k inact / K i ratios >9000 M –1 s –1 . 3-Arylisoxazole ( 10 ) was identified as an isosteric replacement for the five-membered heterocycle, which circumvented the intramolecular cyclization of pyrazole-based inhibitors like 1a . A ligand-based model of the enzyme active site was developed to aid the design of nsP2 protease inhibitors as potential therapeutics against alphaviruses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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