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Enregistrement W4402266317 · doi:10.1158/1538-7445.pediatric24-a007

Abstract A007 DNA damage response deficiency enhances neuroblastoma progression and sensitivity to combination PARP and ATR inhibition

2024· article· en· W4402266317 sur OpenAlexaffabout
Madeline N. Hayes, Sarah Cohen‐Gogo, Lynn Kee, Mehdi Layeghifard, Ivette Valencia-Sama, Anisha Rajaselvam, David R. Kaplan, Anita Villani, Adam Shlien, Daniel A. Morgenstern, Meredith S. Irwin

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePARP inhibition in cancer therapy
Établissements canadiensUniversity of TorontoHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDNA damageNeuroblastomaCancer researchPoly ADP ribose polymeraseMedicineBiologyDNAGeneticsPolymeraseCell culture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: Significant progress has been made in identifying mutations and defining biological heterogeneity in neuroblastoma (NB) using high-throughput sequencing approaches. However, functional roles for many specific genetic alterations in NB initiation, growth, and metastasis remain to be fully defined. Pathogenic and/or likely pathogenic (P/LP) alterations in genes involved in DNA Damage Response (DDR) pathways were identified in approximately 30% of patients enrolled in the SickKids Cancer Sequencing Program (KiCS). Despite being well studied in many adult cancers, roles for DDR disruption and potential therapeutic implications remains poorly understood for NB and other pediatric solid tumors. Aims: We aimed to define roles for DDR-deficiency in NB progression and assess the therapeutic potential of targeted agents using patient-specific DDR loss-of-function NB models. Methods: We incorporated loss-of-function mutations in atm, brca2, palb2, and bard1 into an established zebrafish MYCN-driven model of human NB and characterized tumor progression, transcriptional signatures, and response to candidate therapeutics in vivo. Human cell lines with DDR protein knock-down were used to assess candidate drug combinations in vitro. Results: Mutations in DDR genes were found to enhance tumor penetrance and metastasis in MYCN-driven zebrafish NB, and resulted in upregulation of proliferation, cell cycle checkpoint, and DNA damage repair transcriptional signatures. Zebrafish DDR-deficient NB and human NB cells with DDR protein knock-down were sensitive to the poly(ADP-ribose)-polymerase (PARP) inhibitor olaparib, and this effect was further enhanced by inhibition of the ataxia telangiectasia and rad3 related (ATR) kinase. Conclusions: Our data supports an in vivo functional role for DDR-deficiency in NB, as well as potential molecular vulnerabilities. Pre-clinical assessments in vitro and in vivo suggest therapeutic potential for combination PARP + ATR inhibition in NB patients with alterations in DDR genes. Citation Format: Madeline N. Hayes, Sarah Cohen-Gogo, Lynn Kee, Mehdi Layeghifard, Ivette Valencia-Sama, Anisha Rajaselvam, David Kaplan, Anita Villani, Adam Shlien, Daniel A. Morgenstern, Meredith S Irwin. DNA damage response deficiency enhances neuroblastoma progression and sensitivity to combination PARP and ATR inhibition [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference in Cancer Research: Advances in Pediatric Cancer Research; 2024 Sep 5-8; Toronto, Ontario, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2024;84(17 Suppl):Abstract nr A007.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,062
Tête enseignante GPT0,448
Écart entre enseignants0,386 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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