Abstract A043 Plasma circulating proteomic markers are associated with metastatic spread and outcome in osteosarcoma
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background: Osteosarcoma is the most frequent bone cancer in children and young adults. Histological response and control of primary metastases are the main prognostic clinical factors, but are insufficient to identify the ∼30% of hard-to-treat patients and are not predictive of the response to combinations of chemotherapies or biological treatments. Our aim was to evaluate if circulating proteomic analyses could predict tumor progression. Methods: 88 plasma samples from newly diagnosed patients with osteosarcoma in the OS2006 trial were sequenced using the OLINK Explore panel (3072 proteins) and 88 more coming from the SARCOME13 trial will be used as a validation cohort. Results: Principal component analysis defined co-circulating proteins associated to critical biological pathways involved in osteosarcoma oncogenesis, such as cell adhesion, cell survival/growth, bone formation and extracellular matrix organization. Cox survival analysis associated circulating bone formation pathway with OS(HR=1.10 [1.03;1.17], p=0.006) and PFS(HR=1.12 [1.05;1.19], p=<0.001). These circulating pathways were also associated with presence of metastases at diagnosis (odd ratio = 1.33 [1.12;1.72], p=0.006). These results are being validated on SARCOME13 data. Conclusion: Proteomic plasma markers quantification in patients with osteosarcoma at diagnosis capture a biological signal significantly associated to prognosis and the presence of metastasis at diagnosis. Citation Format: Baptiste Audinot, Damien Drubay, Maria Eugenia Da Costa, Gael Moquin Beaudry, Marta Jimenez, Birgit Geoerger, Nathalie Gaspar, Samuel Abbou, Antonin Marchais. Plasma circulating proteomic markers are associated with metastatic spread and outcome in osteosarcoma [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference in Cancer Research: Advances in Pediatric Cancer Research; 2024 Sep 5-8; Toronto, Ontario, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2024;84(17 Suppl):Abstract nr A043.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».