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Enregistrement W4402266832 · doi:10.1158/1538-7445.pediatric24-a081

Abstract A081 Biomarker-driven targeting of NAD metabolism in rhabdomyosarcoma

2024· article· en· W4402266832 sur OpenAlexaboutno aff
Juan C. Vasquez, Prateek Bhardwaj, Sophia Zhao, Katelyn J. Noronha, Karlie N. Lucas, Ranjini K. Sundaram, Collin D. Heer, Raffaella Morotti, Josh Spurrier, Ranjit S. Bindra

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiomarkerNAD+ kinaseRhabdomyosarcomaCancer researchMedicineBiologyBiochemistryPathologySarcomaEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction/Background: New treatments are needed to improve survival in rhabdomyosarcoma (RMS). Cells primarily synthesize nicotinamide adenine dinucleotide (NAD+) through the Preiss-Handler and Salvage pathways driven by nicotinic acid phosphoribosyltransferase (NAPRT) and nicotinamide phosphoribosyltransferase (NAMPT), respectively. NAMPT inhibitors (NAMPTi) have been tested in clinical trials, but their efficacy has been limited by lack of appropriate biomarkers for patient selection. Here, we sought to determine if RMS harbors NAPRT silencing that confers a synthetic lethal interaction with NAMPTi. Methods: NAPRT expression was evaluated by immunohistochemistry (IHC) in human tumor samples. In vitro cell viability assays were performed in RMS cell lines using a panel of NAMPT inhibitors. RMS cells isogenic for NAPRT expression were generated via overexpression or CRISPR/Cas9 KO. For in vivo experiments, orthotopic tumor-bearing mice were treated with vehicle control or OT-82 at 25 mg/kg/dose by oral gavage with or without nicotinic acid (NA) at 25 mg/kg/dose once daily for 3 days per week. Results: In vitro, NAPRT negative isogenic RMS cells showed an exquisite sensitivity to a panel of NAMPT inhibitors. When NA was supplemented to model physiologic conditions, NAPRT+ cells were rescuved while cells harboring loss of NAPRT remained sensitive. In vivo, NAMPTi treatment induced significant tumor regression and improved survival in a NAPRT null RMS xenograft model even in the presence of NA, while NAPRT+ tumors did not response to NAMPTi when combined with NA supplementation. IHC staining in a collection of RMS tissue microarrays obtained from the Children’s Oncology Group demonstrated loss of NAPRT protein expression in roughly 25% of tumors.Conclusion: Overall, these data suggest that NAPRT loss may serve as a therapeutic target in RMS by inducing a synthetic lethal interaction with NAD+ depleting agents. Future studies will determine if NA supplementation can mitigate toxicity and widen the therapeutic index, paving the way for the development of biomarker-driven clinical trials in RMS. Citation Format: Juan C. Vasquez, Prateek Bhardwaj, Sophia Zhao, Katelyn Noronha, Karlie Lucas, Ranjini Sundaram, Collin Heer, Raffaella Morotti, Josh Spurrier, Ranjit S Bindra. Biomarker-driven targeting of NAD metabolism in rhabdomyosarcoma [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference in Cancer Research: Advances in Pediatric Cancer Research; 2024 Sep 5-8; Toronto, Ontario, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2024;84(17 Suppl):Abstract nr A081.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,067
Tête enseignante GPT0,412
Écart entre enseignants0,345 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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