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Enregistrement W4402267868 · doi:10.1158/1538-7445.pediatric24-a029

Abstract A029 Investigating the role of environmental toxicant exposures and STAG2 loss in sarcomagenesis

2024· article· en· W4402267868 sur OpenAlexaboutno aff
Rachael Kohrn, Joyce E. Ohm

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueAntioxidants, Aging, Portulaca oleracea
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésToxicantEnvironmental healthMedicineToxicityInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Humans are exposed to a variety of environmental toxicants which have been implicated in contributing to cancer development. A possible explanation for this link is that adaptive epigenetic changes occur in stem cell populations upon toxicant exposure. These cells are particularly vulnerable during developmental stages, leading to abnormal gene expression later in life. Environmental exposures have been associated with the initiation of sarcoma development. This study will focus on Ewing Sarcoma (ES), as this malignancy has a low mutational burden relative to other cancer types and is thought to be linked to agricultural chemicals. We are also focusing on stromal antigen 2 (STAG2), which is found to be frequently mutated in ES in addition to multiple other tumor types. Patients with STAG2-mutated ES have higher rates of metastatic disease and worse outcomes, but the reason for this remains poorly understood. STAG2 plays a role in the regulation of genomic organization, DNA repair, and modulation of replication stress (RS). It has also been shown that STAG2 loss may lead to dysregulation of the cGAS-STING pathway, which is critical for tumor immunosurveillance. We are testing the effects of environmental toxicants in mesenchymal stem cells (MSCs), the putative cell of origin for ES and many other sarcomas. We have successfully used CRISPR/Cas9 to generate STAG2 knockout MSCs. With this model, we are testing the effects of STAG2 loss and toxicant exposure on levels of RS, epigenomic instability, and innate immune suppression in MSCs. Our results indicate that these toxicants alter the cell cycle dynamics of MSCs, and that these alterations change depending on STAG2 status. We have also observed changes in the DNA damage response of STAG2-mutant MSCs when exposed to environmental toxicants. Interestingly, effects were seen even at sub-lethal doses that may reflect common, low-level exposures. We believe that our data will contribute to the understanding of the mechanism by which environmental toxicants facilitate malignant transformation of Ewing sarcoma and other pediatric sarcomas. Citation Format: Rachael Kohrn, Joyce Ohm. Investigating the role of environmental toxicant exposures and STAG2 loss in sarcomagenesis [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference in Cancer Research: Advances in Pediatric Cancer Research; 2024 Sep 5-8; Toronto, Ontario, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2024;84(17 Suppl):Abstract nr A029.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,186
Score d'incertitude au seuil0,365

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,074
Tête enseignante GPT0,364
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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Résumé présentoui

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