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Enregistrement W4402271344 · doi:10.1038/s41467-024-52096-w

Immune landscape of oncohistone-mutant gliomas reveals diverse myeloid populations and tumor-promoting function

2024· article· en· W4402271344 sur OpenAlexafffund
Augusto Faria Andrade, Alva Annett, Elham Karimi, Danai G. Topouza, Morteza Rezanejad, Y. Lucy Liu, Michael McNicholas, Eduardo Gonzalez Santiago, Dhana Llivichuzhca-Loja, Arne Gehlhaar, Selin Jessa, Antonella De Cola, Bhavyaa Chandarana, Caterina Russo, Damien Faury, Geoffroy Danieau, Evan Puligandla, Yuhong Wei, Michele Zeinieh, Qing Wu, Steven Hébert, Nikoleta Juretic, Emily M. Nakada, Brian Krug, Valérie Larouche, Alexander G. Weil, Roy Dudley, Jason Karamchandani, Sameer Agnihotri, Daniela F. Quail, Benjamin Ellezam, Liza Konnikova, Logan A. Walsh, Manav Pathania, Claudia L. Kleinman, Nada Jabado

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune cells in cancer
Établissements canadiensMcGill Genome CentreMontreal Children's HospitalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineUniversité de MontréalUniversité LavalJewish General HospitalMontreal Neurological Institute and HospitalUniversity of TorontoMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Center for Advancing Translational SciencesNational Cancer InstituteFonds de Recherche du Québec - SantéNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchMcGill UniversityCanadian Cancer Society Research InstituteMcGill University Health CentreNational Institutes of HealthGovernment of OntarioAlliance de recherche numérique du CanadaFondation Charles-BruneauJewish General HospitalGreat Ormond Street Hospital CharityGovernment of CanadaGenome CanadaBrain Research UKNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCancer Research SocietyStand Up To CancerGénome QuébecCancer Research UKYale University
Mots-clésImmune systemMutantMyeloid cellsMyeloidGliomaFunction (biology)BiologyCancer researchImmunologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Histone H3-mutant gliomas are deadly brain tumors characterized by a dysregulated epigenome and stalled differentiation. In contrast to the extensive datasets available on tumor cells, limited information exists on their tumor microenvironment (TME), particularly the immune infiltrate. Here, we characterize the immune TME of H3.3K27M and G34R/V-mutant gliomas, and multiple H3.3K27M mouse models, using transcriptomic, proteomic and spatial single-cell approaches. Resolution of immune lineages indicates high infiltration of H3-mutant gliomas with diverse myeloid populations, high-level expression of immune checkpoint markers, and scarce lymphoid cells, findings uniformly reproduced in all H3.3K27M mouse models tested. We show these myeloid populations communicate with H3-mutant cells, mediating immunosuppression and sustaining tumor formation and maintenance. Dual inhibition of myeloid cells and immune checkpoint pathways show significant therapeutic benefits in pre-clinical syngeneic mouse models. Our findings provide a valuable characterization of the TME of oncohistone-mutant gliomas, and insight into the means for modulating the myeloid infiltrate for the benefit of patients. Histone H3-mutant gliomas are deadly brain tumours and the tumour microenvironment is not fully understood. Here the authors profile the immune microenvironment from human samples and mouse models and implicate myeloid cells in immune suppression and show inhibition of myeloid cells and checkpoint blockade demonstrates therapeutic benefits in mice.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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