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Enregistrement W4402281454 · doi:10.1101/2024.09.03.610819

Personalized models of Disorders of Consciousness reveal complementary roles of connectivity and local parameters in diagnosis and prognosis

2024· preprint· en· W4402281454 sur OpenAlexaff
Lou Zonca, Anira Escrichs, Gustavo Patow, Dragana Manasova, Yonatan Sanz Perl, Jitka Annen, Olivia Gosseries, Jacobo Sitt, Gustavo Deco

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDimension (graph theory)NeuroimagingDimensionality reductionVariety (cybernetics)Computer scienceNode (physics)ConsciousnessPipeline (software)Artificial intelligencePersistent vegetative stateMachine learningCurse of dimensionalitySpace (punctuation)PsychologyData scienceData miningNeuroscienceMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The study of disorders of consciousness (DoC) is very complex because patients suffer from a wide variety of lesions, affected brain mechanisms, different severity of symptoms, and are unable to communicate. Combining neuroimaging data and mathematical modeling can help us quantify and better describe some of these alterations. The goal of this study is to provide a new analysis and modeling pipeline for fMRI data leading to new diagnosis and prognosis biomarkers at the individual patient level. To do so, we project patients' fMRI data into a low-dimension latent-space. We define the latent space's dimension as the smallest dimension able to maintain the complexity, non-linearities, and information carried by the data, according to different criteria that we detail in the first part. This dimensionality reduction procedure then allows us to build biologically inspired latent whole-brain models that can be calibrated at the single-patient level. In particular, we propose a new model inspired by the regulation of neuronal activity by astrocytes in the brain. This modeling procedure leads to two types of model-based biomarkers (MBBs) that provide novel insight at different levels: (1) the connectivity matrices bring us information about the severity of the patient's diagnosis, and, (2) the local node parameters correlate to the patient's etiology, age and prognosis. Altogether, this study offers a new data processing framework for resting-state fMRI which provides crucial information regarding DoC patients diagnosis and prognosis. Finally, this analysis pipeline could be applied to other neurological conditions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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