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Enregistrement W4402304784 · doi:10.1101/2024.09.05.24313101

Fetal hemoglobin enables malaria parasite growth in sickle cells but augments production of transmission stage parasites

2024· preprint· en· W4402304784 sur OpenAlexaff
Catherine Lavazec, Cheikh Loucoubar, Florian Dupuy, Jean‐François Bureau, Isabelle Casadémont, Bronner P. Gonçalves, Swee Lay Thein, Mark Lathrop, Sandrine Laurance, Camille Roussel, Caroline Le Van Kim, Yves Colin, Mariane de Montalembert, Anavaj Sakuntabhai, Richard Paúl

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHemoglobinopathies and Related Disorders
Établissements canadiensMcGill Genome Centre
Organismes subventionnairesCentre National de la Recherche ScientifiqueInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésMalariaParasite hostingFetal hemoglobinHemoglobinTransmission (telecommunications)FetusBiologyStage (stratigraphy)ImmunologyPregnancyComputer scienceGeneticsBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Sickle cell trait is the quintessential example of the human response to malaria, providing protection against severe disease, but leading to sickle cell disease (SCD) in the homozygous state. Fetal Hemoglobin (HbF) reduces the pathology of SCD and several mutations lead to the prolonged production of HbF into childhood and adult life. HbF has been suggested to contribute to protection against malaria. Two long-term cohorts were genotyped for three quantitative trait loci associated with HbF production and analyzed for HbF titers, malaria clinical episodes and the production of parasite stages infectious to mosquitoes, gametocytes in asymptomatic infections. Plasmodium falciparum parasites were also grown in vitro in HbSS cells with measured levels of HbF. The genetic determinants of prolonged HbF production were associated with increased HbF titers and that increased HbF afforded protection from malaria disease but increased the production of gametocytes. The presence of HbF in sickled red cells was also shown in in vitro culture to enable parasite persistence in conditions otherwise deleterious for the parasite and enabled complete maturation of gametocytes. The beneficial personal effect of HbF, whether through protection against malaria or alleviating effects of SCD, is offset by increased parasite transmissibility and disease burden for the community. These individuals represent an important reservoir of infection and need to be targeted in elimination strategies. Key points Individuals with mutations associated with fetal hemoglobin production had fewer clinical episodes but produced more gametocytes. HbF in red blood cells enables gametocyte production at tissue level oxygen partial pressures at which normally parasite lysis would occur.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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