P-13 Genomic variation in symptom expression in men with castrate resistant prostate cancer
Notice bibliographique
Résumé
Background Men with castrate resistant prostate cancer (CRPC) suffer from symptoms related to both their disease and its treatment with marked variation between individuals with respect to symptom expression despite similar tumour burdens. This may be related to genetic variation. Objective This study aimed to determine whether genetic variation in cytokine expression can predict severity of symptoms in men with CRPC and investigate whether symptom severity was related to tumour burden. Methods A prospective, longitudinal consecutive patient cohort study across two Queensland sites. Patient characteristics including tumour burden and current treatment were collected at baseline. Symptom severity was assessed using the Edmonton Symptom Assessment Scale (ESAS-R) 3–4 weekly for up to 6 assessments, with blood taken for genetic analysis once during the study. Cytokine gene variants of each participant were assessed using a panel of SNPs most reported to be associated with symptom variation in the literature. Analysis was performed using R software and the package SNPassoc (R Core team, 2021; Gonzalez JR. et al, 2007). Results Twenty-eight of 67 (42%) of participants had a low, and 39/67 (58%) a high tumour burden. Tumour burden remained constant throughout the study period for all participants. Twenty-six of 67 (39%) participants were classified as having low ESAS-R severity and 67 (61%) as high ESAS-R severity. Symptom severity was not related to tumour burden or patient characteristics. One hundred and forty-four SNPs from 63 participants were analysed, of which results were available for 142 SNPs. Fifteen SNPs were significantly associated with symptom severity. In multivariable analysis, SNP rs2069772 in IL2 (p = 0.001), rs1554606 in IL6 (p=0.003), rs2227306 in IL8 (p=0.008) and rs2069718 in IFNG (p=0.001) were highly predictive of symptom severity. Discussion Although multiple factors can influence symptom severity, genetic variation may well play a part. The early identification of men likely to develop severe symptoms during the course of their prostate cancer could theoretically enable symptoms to be managed more aggressively from an early stage. Our findings also add to the expanding data bases that document the associations of genetic polymorphism with both disease and symptom expression.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».