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Enregistrement W4402329620 · doi:10.1038/s41467-024-51679-x

Smoking and alcohol by HPV status in head and neck cancer: a Mendelian randomization study

2024· article· en· W4402329620 sur OpenAlexafffund
Abhinav Thakral, Jong Wook Lee, Tianzhichao Hou, Katrina Hueniken, Tom Dudding, Mark Gormley, Shama Virani, Andrew F. Olshan, Brenda Diergaarde, Tim Waterboer, Karl Smith-Byrne, Paul Brennan, D. Neil Hayes, Eleanor Sanderson, M. Catherine Brown, Sophie Huang, Scott V. Bratman, Anna Spreafico, John R. de Almeida, Joel Davies, Laura J. Bierut, Gary J. Macfarlane, Παγώνα Λάγιου, Areti Lagiou, Jerry Polesel, Antonio Agudo, Laia Alemany, Wolfgang Ahrens, Claire M. Healy, David I. Conway, Mari Nygård, Cristina Canova, Ivana Holcátová, Lorenzo Richiardi, Ariana Znaor, David P. Goldstein, Wei Xu, Geoffrey Liu, Osvaldo Espin‐Garcia

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHead and Neck Cancer Studies
Établissements canadiensWestern UniversityPublic Health OntarioLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteUniversity Health NetworkUniversity of TorontoSinai Health SystemPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesNational Institute of Dental and Craniofacial ResearchNational Institute of Environmental Health SciencesNational Cancer InstituteUniversität BremenMinistero della SaluteCanadian Cancer Society Research InstituteNational Institutes of HealthCancer Research UKCanadian Institutes of Health ResearchCompagnia di San PaoloNational Institute for Health and Care ResearchWorld Health OrganizationEuropean CommissionUniversity of Pittsburgh
Mots-clésMendelian randomizationHead and neck cancerMedicineHead and neckCancerAlcohol consumptionAlcoholOncologyInternal medicineGeneticsBiologySurgeryGeneGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

HPV-positive and HPV-negative head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC) are recognized as distinct entities. There remains uncertainty surrounding the causal effects of smoking and alcohol on the development of these two cancer types. Here we perform multivariable Mendelian randomization (MR) to evaluate the causal effects of smoking and alcohol on the risk of HPV-positive and HPV-negative HNSCC in 3431 cases and 3469 controls. Lifetime smoking exposure, as measured by the Comprehensive Smoking Index (CSI), is associated with increased risk of both HPV-negative HNSCC (OR = 3.03, 95%CI:1.75-5.24, P = 7.00E-05) and HPV-positive HNSCC (OR = 2.73, 95%CI:1.39-5.36, P = 0.003). Drinks Per Week is also linked with increased risk of both HPV-negative HNSCC (OR = 7.72, 95%CI:3.63-16.4, P = 1.00E-07) and HPV-positive HNSCC (OR = 2.66, 95%CI:1.06-6.68, P = 0.038). Smoking and alcohol independently increase the risk of both HPV-positive and HPV-negative HNSCC. These findings have important implications for understanding the modifying risk factors between HNSCC subtypes. Head and neck squamous cell carcinoma can occur with and without the presence of HPV infection. Here, the authors utilise Mendelian randomization to assess the causal effects of smoking and alcohol on HPV-positive and HPV-negative head and neck cancer development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,333
Score d'incertitude au seuil0,384

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,387
Écart entre enseignants0,352 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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