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Enregistrement W4402334170 · doi:10.1101/2024.09.06.611641

PIEZO-dependent mechano-sensing of the niche is essential for intestinal stem cell fate decision and maintenance

2024· preprint· en· W4402334170 sur OpenAlexafffund
Meryem B. Baghdadi, Ronja M. Houtekamer, Louisiane Perrin, Abilasha Rao‐Bhatia, Myles Whelen, Linda Decker, Martin Bergert, Carlos Pérez‐González, Réda Bouras, Giacomo Gropplero, Adrian KH Loe, Amin Afkhami-Poostchi, Xin Chen, Xiyong Huang, Stéphanie Descroix, Jeffrey L. Wrana, Alba Diz-Muñoz, Martijn Gloerich, Arshad Ayyaz, Danijela Matic Vignjevic, Tae-Hee Kim

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueErythrocyte Function and Pathophysiology
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteUniversity of CalgaryHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchEuropean CommissionEuropean Molecular Biology Laboratory
Mots-clésNicheStem cellStem cell nicheCell biologyNeuroscienceComputer scienceBusinessBiologyEcologyProgenitor cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Stem cells continuously perceive and respond to various environmental signals to maintain homeostasis. In addition to biochemical factors, the stem cell niche is subjected to mechanical and physical cues. However, it remains unclear how stem cells can sense mechanical signals from their niche in vivo . Since intestinal stem cells constantly and directly face the external environment, we investigated the roles of mechano-sensing PIEZO ion channels in the gut stem cell niche. By employing mouse genetics and performing single-cell RNAseq analysis, we revealed the absolute requirement for PIEZO channels in intestinal stem cell (ISC) state dynamics and maintenance. In vivo measurement of basement membrane region stiffness demonstrated that ISCs reside in a more rigid microenvironment at the bottom of the crypt. Using 3D and 2D organoid systems combined with bioengineered substrates and a cell stretching device, we found that PIEZO channels are activated by high extracellular matrix stiffness and tissue tension to modulate ISC behavior. This study delineates the mechanistic cascade of PIEZO channel activation in ISCs from the upstream extracellular stimuli through the downstream signaling activation that coordinates stem cell fate decision and maintenance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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