MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4402343609 · doi:10.1016/j.celrep.2024.114695

Paraspeckle-independent co-transcriptional regulation of nuclear microRNA biogenesis by SFPQ

2024· article· en· W4402343609 sur OpenAlexafffund
Caroline Thivierge, Maxime Bellefeuille, Sarah-Slim Diwan, Boris J.A. Dyakov, Rania Leventis, Gabrielle Perron, Hamed S. Najafabadi, Simon‐Pierre Gravel, Anne‐Claude Gingras, Thomas F. Duchaîne

Notice bibliographique

RevueCell Reports · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensMcGill Genome CentreMcGill UniversityUniversité de MontréalLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaFonds de Recherche du Québec-Société et CultureOkayama UniversityHarvard University
Mots-clésDroshaRNA-binding proteinBiologymicroRNACell biologyGene silencingRNA splicingExosomeSplicing factorRegulation of gene expressionRNA interferenceRNAGeneticsGeneMicrovesicles

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

MicroRNAs (miRNAs) play crucial roles in physiological functions and disease, but the regulation of their nuclear biogenesis remains poorly understood. Here, BioID on Drosha, the catalytic subunit of the microprocessor complex, reveals its proximity to splicing factor proline- and glutamine (Q)-rich (SFPQ), a multifunctional RNA-binding protein (RBP) involved in forming paraspeckle nuclear condensates. SFPQ depletion impacts both primary and mature miRNA expression, while other paraspeckle proteins (PSPs) or the paraspeckle scaffolding RNA NEAT1 do not, indicating a paraspeckle-independent role. Comprehensive transcriptomic analyses show that SFPQ loss broadly affects RNAs and miRNA host gene (HG) expression, influencing both their transcription and the stability of their products. Notably, SFPQ protects the oncogenic miR-17∼92 polycistron from degradation by the nuclear exosome targeting (NEXT)-exosome complex and is tightly linked with its overexpression across a broad variety of cancers. Our findings reveal a dual role for SFPQ in regulating miRNA HG transcription and stability, as well as its significance in cancers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,114
Score d'incertitude au seuil0,354

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCell ReportsMême sujetRNA Research and SplicingTravaux en français237 207