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Enregistrement W4402355372 · doi:10.1159/000541298

Causal Relationships between Gut Microbiotas, Blood Metabolites, and Neuroendocrine Tumors: A Mediated Mendelian Randomization Study

2024· article· en· W4402355372 sur OpenAlexaboutno aff
ZheXu Cao, JiangSheng Huang, Xia Long

Notice bibliographique

RevueNeuroendocrinology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMendelian randomizationGut floraRectumBiologyNeuroendocrine tumorsInternal medicineDiseaseMedicinePhysiologyBioinformaticsOncologyGastroenterologyGeneticsImmunologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Neuroendocrine tumors (NETs) are a heterogeneous group of epithelial tumors originating from different anatomical sites, and identifying the gut microbiota and metabolic mechanisms involved in the onset of NETs may help to develop appropriate disease prevention and monitoring strategies. METHODS: We employed a mediated two-sample Mendelian randomization (MR) approach, analyzing gut microbiota from German studies and NET datasets from the 10th round of the FinnGen project. Mediation analyses were conducted using the metabolites dataset from the Canadian Longitudinal Study of Aging (CLSA) and the TwinsUK study. Instrumental variables were chosen according to established MR criteria and analyzed using the Wald ratio, inverse-variance weighted (IVW), MR-Egger, and weighted median methods. To ensure robustness, sensitivity analyses were performed using Cochrane's Q, Egger's intercept, MR-PRESSO, and leave-one-out methods. RESULTS: Causal relationships were identified between the genetic determinants of 6, 5, 2, 1, 2, 3 gut microbiotas and the risk of colorectal, lung, pancreatic, rectum, small intestine, and stomach NETs. Similarly, the genetic determinants of 4, 6, 1, 5, 10, and 7 metabolites were found to be causally related to the risk of colorectal, lung, pancreatic, rectum, small intestine, and stomach NETs, respectively. Through Wald ratio and IVW methods, we preliminarily identified 957 microbiota-metabolite pairs with significant causal associations and formed 13 mediated relationships between the impact of gut microbiotas on NETs. CONCLUSION: Our study suggests that gut microbiotas and its derived metabolites may contribute to the onset of NET, offering a novel insight into the disease's pathogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,816
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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