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Enregistrement W4402383749 · doi:10.20944/preprints202409.0522.v1

Clinical Expression of Familial Hypercholesterolemia in Patients from France and French Canada Carrying Identical by Descent Pathogenic LDLR Gene Variants: a Proof-of-Concept Study

2024· preprint· en· W4402383749 sur OpenAlexaboutno aff
Miriam Larouche, Olivier Bluteau, Alain Carrié, Alex Lauzière, Étienne Khoury, Diane Brisson, Daniel Gaudet, Antonio Gallo

Notice bibliographique

RevuePreprints.org · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLipoproteins and Cardiovascular Health
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFamilial hypercholesterolemiaLDL receptorGeneGeneticsExpression (computer science)MedicineBiologyInternal medicineCholesterolLipoproteinComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Studying patients carrying identical by descent (IBD) pathogenic gene variants allows to control for the disease-causing genetic background and to more accurately document the impact of modifiers. Familial hypercholesterolemia (FH) is characterized by elevated LDL-c levels, premature atherosclerosis and is often caused by defects in the LDLR gene. There is a high prevalence of FH in French Canada carry IBD FH-causing due to a founder effect from France in the 17th Century. Several FH patients currently living in French Canada (founder population) and in France (colonizing population) carry IBD FH-causing variants. The expression of FH is affected by environmental and genetic modifiers and patients with IBD variants may present different characteristics. Methods: In this study, we compared FH clinical expression patients carrying IBD LDLR pathogenic variants living in France or Canada. Four IBD variants, namely c.259T>G p.(Trp87Gly); c.2000G>A p.(Cys667Tyr); c.682G>A p.(Glu228Lys); and c.1048C>T p.(Arg350*) were selected. Untreated plasma lipid profiles, APOE genotype, cardiovascular risk factors and occurrence of symptomatic ASCVD were compared in 105 adult carriers (30 from France and 75 from French Canada). Results: All parameters were similar between the two populations, except for untreated total cholesterol (10.14 ± 1.89 mmol/L vs 8.65 ± 1.84 mmol/L, p=0.0006) and LDL-c concentrations (7.94 ± 1.86 mmol/L vs 6.93 ± 1.78 mmol/L, p=0.016) that were significantly higher in FH patients living in France, a trend that was observed in all studied LDLR variants. Conclusion: This study illustrates that FH patients sharing IBD pathogenic LDLR variants that have evolved in different geographic, cultural and socio-economic environments for hundreds of years, differ in term of cholesterol levels highlighting the importance of better understanding the interplay between genetic and environmental modulators of FH expression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,854
Score d'incertitude au seuil0,291

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,331
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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