Novel Pannexin 1 isoform is increased in cancer
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Alternative translation initiation (ATI) is a process of increasing protein diversity from one transcript, allowing cells to rapidly respond to signals, which is particularly important in cancer cells. Here, we report potential internal translation start sites exist in PANX1 which have implications in trafficking and channel function. Using mouse (mPANX1) constructs for each internal methionine, we saw that these PANX1 isoforms were N-glycosylated, could traffic to the cell surface and mPANX1-M37 formed functional channels activated by C-terminus cleavage or α1-adrenoceptor stimulation. We also identified a ∼25 kDa isoform of mPANX1 (mPANX1-25K) endogenously expressed in mouse melanoma cell lines that could be confirmed with a cognate peptide. mPANX1-25K lacks the mPANX1 N-terminus and most likely corresponds to the M210 internal translation start site since we could not identify any alternative transcripts that would produce this ATI product. When we expressed the human equivalent of M210 in Hs578T PANX1 KO cells with and without wildtype human PANX1, we determined M211 exhibits a predominantly intracellular localization, is N-glycosylated and can interact with full-length human PANX1. Collectively, these findings indicate species specific differences in the abundance of PANX1 ATI isoforms which could act independently or in conjunction with the canonical full-length protein in melanoma. Significance Statement Alternative translation initiation increases the number of proteins produced from a single mRNA. Connexin internal translation isoforms have been characterized in a wide variety of cell contexts and diseases, but it is unknown whether the related pannexins also undergo this process. We discovered a novel 25 kDa mouse pannexin 1 protein (mPANX1-25K), most likely corresponding to an internal methionine start site at M210, which is N-glycosylated and intracellularly localized. This isoform is not expressed in humans. This represents the first report of a PANX1 alternative translation initiation isoform and points to an evolutionary divergence of mouse and human PANX1.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».