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Enregistrement W4402405108 · doi:10.23889/ijpds.v9i5.2616

Wastewater-based surveillance for SARS-CoV-2 in Alberta

2024· article· en· W4402405108 sur OpenAlexaffabout
Danielle A. Southern, Casey R. J. Hubert, Michael D. Parkins, Tyler Williamson

Notice bibliographique

RevueInternational Journal for Population Data Science · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 detection and testing
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)WastewaterCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Environmental science2019-20 coronavirus outbreakWaste managementVirologyEngineeringEnvironmental engineeringMedicineOutbreakInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ObjectiveAlberta's largest research universities collaborated to expand COVID-19 wastewater monitoring throughout the province to regularly provide evidence of SARS-CoV-2 burden in municipalities representing 3.2 million people. ApproachSampling was conducted at 26 wastewater treatment plants and facilities across the province. The project quantified SARS-CoV-2 genomic material in wastewater to reveal population-level trends of COVID-19 cases. This inclusive and comprehensive strategy captures everyone who contributes to wastewater, including those not clinically diagnosed. Researchers collected wastewater samples in municipalities three times a week. Additional sentinel monitoring was undertaken in neighbourhoods, hospitals, long-term care facilities, worksites, shelters, and schools. Results were shared on the public COVID Data Tracker website (https://covid-tracker.chi-csm.ca/). Data was additionally linked with hospital outcomes, workforce absenteeism and outbreak information. ResultsWastewater-based surveillance (WBS) for SARS-CoV-2 genomic RNA associates very strongly with clinically diagnosed cases and health resource utilization, providing a ≥6-day leading indicator. WBS can effectively be performed across a range of geographic scales (from cities to individual facilities), ensuring actionable data that is relevant to end-users. We have published how outbreaks across a range of high-risk facilities can be monitored and predicted with WBS and can also be used to model COVID-19-associated workforce absenteeism. Emails and website interactions suggested widespread citizen engagement using data for evidence-based decisions. ConclusionWBS is a valuable tool for identifying potential outbreaks and tailoring response measures at the policy level and by individual citizens. We've created customizable real-time data-sharing tools catering to both the public (enhanced data transparency) and government (actionable insights).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,762
Score d'incertitude au seuil0,371

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,118
Tête enseignante GPT0,428
Écart entre enseignants0,310 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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