Wastewater-based surveillance for SARS-CoV-2 in Alberta
Notice bibliographique
Résumé
ObjectiveAlberta's largest research universities collaborated to expand COVID-19 wastewater monitoring throughout the province to regularly provide evidence of SARS-CoV-2 burden in municipalities representing 3.2 million people. ApproachSampling was conducted at 26 wastewater treatment plants and facilities across the province. The project quantified SARS-CoV-2 genomic material in wastewater to reveal population-level trends of COVID-19 cases. This inclusive and comprehensive strategy captures everyone who contributes to wastewater, including those not clinically diagnosed. Researchers collected wastewater samples in municipalities three times a week. Additional sentinel monitoring was undertaken in neighbourhoods, hospitals, long-term care facilities, worksites, shelters, and schools. Results were shared on the public COVID Data Tracker website (https://covid-tracker.chi-csm.ca/). Data was additionally linked with hospital outcomes, workforce absenteeism and outbreak information. ResultsWastewater-based surveillance (WBS) for SARS-CoV-2 genomic RNA associates very strongly with clinically diagnosed cases and health resource utilization, providing a ≥6-day leading indicator. WBS can effectively be performed across a range of geographic scales (from cities to individual facilities), ensuring actionable data that is relevant to end-users. We have published how outbreaks across a range of high-risk facilities can be monitored and predicted with WBS and can also be used to model COVID-19-associated workforce absenteeism. Emails and website interactions suggested widespread citizen engagement using data for evidence-based decisions. ConclusionWBS is a valuable tool for identifying potential outbreaks and tailoring response measures at the policy level and by individual citizens. We've created customizable real-time data-sharing tools catering to both the public (enhanced data transparency) and government (actionable insights).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».