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Enregistrement W4402405345 · doi:10.23889/ijpds.v9i5.2610

Methodological Challenges when Using Routinely Collected Health Data for Research: A scoping review.

2024· article· en· W4402405345 sur OpenAlexaff
Lili Wei, M Ellen Kuenzig, James Im, Yan Zheng, Taylor McLinden, Scott D. Emerson, Azza Eissa, Henry Halder, Richard Shaw, An‐Wen Chan, William G Dixon, Véra Ehrenstein, Astrid Guttmann, Katie Harron, Lars G. Hemkens, Asbjørn Hróbjartsson, Ronan A Lyons, Shannon E. MacDonald, Jerry M Maniate, David Moher, Irene Petersen, Hude Quan, Sigrún Alba Jóhannesdóttir Schmidt, Henrik Toft Sørensen, Shirley Wang, David McAllister, Sinéad Langan, Eric I. Benchimol

Notice bibliographique

RevueInternational Journal for Population Data Science · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineSocial Sciences
ThématiqueHealth disparities and outcomes
Établissements canadiensUniversity of CalgaryUniversity of OttawaUniversity of AlbertaAlberta Health ServicesUniversity of TorontoSimon Fraser UniversityAIDS VancouverHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesEconomic and Social Research Council
Mots-clésData scienceData qualityProtocol (science)Computer scienceHealth informaticsTransparency (behavior)InformaticsComparabilityResearch designManagement scienceMedicinePublic healthAlternative medicinePolitical scienceEngineeringNursing

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Routinely collected health data (RCD) including electronic health records, disease registries, health administrative data and wearables data are not specifically collected for research purposes. Analysis of these data poses unique methodological challenges that must be addressed when conducting research, particularly as availability and use increase. This scoping review aimed to identify methodological challenges in research using RCD from existing literature (registered protocol: https://doi.org/10.17605/OSF.IO/EBM4D). We searched 6 electronic databases, including medical, health economics, nursing and psychology research databases, between Jan 2015 and Jan 2023, combining multiple “RCD” and “research” search terms (e.g., epidemiologic, informatics, pharmaceutical research). After screening abstracts and full-texts, we doubly extracted methodological themes, categorizing them into different study stages. We screened more than 23,000 records and included 430 papers. Bias and confounding were the most common methodological issues identified, discussed in relation to both study design and data analysis. Data quality, including data accuracy, validation, completeness, timeliness and cleaning, also posed substantial challenges, particularly during data processing stage. Record linkage and conducting analyses using distributed health networks also pose unique methodological challenges. Heterogeneity, incorporating social determinants of health and statistical models that address methodological challenges are also described in the literature. External validity and reporting are important considerations for RCD research. Our review identified several methodological challenges facing researchers using RCD. These issues should be addressed to ensure methodologically sound research. These findings will inform the development of a standardized protocol template and accompanying educational platform aimed at enhancing methodological quality and transparency when conducting research using RCD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,399
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,706
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,601
Score d'incertitude au seuil0,742

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,3990,706
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,004
Méta-épidémiologie (sens large)0,0090,010
Bibliométrie0,0370,041
Études des sciences et des technologies0,0040,008
Communication savante0,0150,017
Science ouverte0,0080,010
Intégrité de la recherche0,0090,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,933
Tête enseignante GPT0,723
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeRevue systématique
DomaineMéthodes
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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