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Enregistrement W4402423264 · doi:10.24908/iqurcp17945

Uncovering crosstalk between AMPK and the ATF4-Integrated Stress Response

2024· article· en· W4402423264 sur OpenAlexaffvenue
Lindsey Smee, Elise Galloro

Notice bibliographique

RevueInquiry Queen s Undergraduate Research Conference Proceedings · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism, Diabetes, and Cancer
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCrosstalkIntegrated stress responseATF4AMPKCell biologyChemistryEngineeringUnfolded protein responseBiologyElectronic engineeringBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The reprograming of cellular metabolism in cancer cells is directly inter-related to their capacity for uncontrolled growth. As such, targeting of mitochondrial function has been explored as a therapeutic strategy in cancer. However, inhibition of mitochondria inevitably leads to activation of cellular stress pathways including the integrated stress response (ISR). The ISR includes as a key feature, increased activity of activating transcription factor 4 (ATF4), which goes on to up-regulate a range of gene targets to restore cellular homeostasis. Inhibition of mitochondria also can impair bioenergetic and biosynthetic capacity, which might activate AMP-activated protein kinase (AMPK), a cellular energy sensor that also orchestrates metabolic homeostasis. While the ISR and AMPK both critically regulate metabolism in cancer cells, the link between these mechanisms remains unclear. To address this gap, we tested effects of various energetic stress conditions in MEF cell systems deficient in AMPK activity. To comprehensively impair metabolic networks, we used nutrient starvation treatments in combination with silencing of the protein OPA1 which maintains organisational integrity of the mitochondrial cristae. Our results suggest that AMPK may be involved in suppressing the ISR upon mitochondrial disruption. To further explore, we took the alternative approach to test a range of mitochondrial targeting drugs in wildtype or AMPK-deficient MEF. To gain insight into roles of AMPK in the ISR and related adaptive gene responses, we analysed resulting transcriptomes. These results further revealed a regulatory link between AMPK and the ATF4-ISR, showing that AMPK loss hypersensitizes the cell to energetic stress. Our work uncovering the crosstalk between AMPK and the ATF4-ISR has potential to reveal novel interactions that could suggest metabolic liabilities that may be relevant for targeting in cancer cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,358
Écart entre enseignants0,307 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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