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Enregistrement W4402436724 · doi:10.1101/2024.09.09.24313184

A prebiotic diet intervention can restore faecal short chain fatty acids in Parkinson's Disease yet fails to restore the gut microbiome homeostasis

2024· preprint· en· W4402436724 sur OpenAlexaff
Janis R. Bedarf, Stefano Romano, Silke S. Heinzmann, Anthony Duncan, Μαρία Τράκα, Duncan Y. K. Ng, Daniella Segovia-Lizano, Marie‐Christine Simon, Arjan Narbad, Ullrich Wuellner, Falk Hildebrand

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDiet and metabolism studies
Établissements canadiensCentre for Movement Disorders
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilHorizon 2020 Framework Programme
Mots-clésPrebioticGut microbiomeMicrobiomeParkinson's diseaseGut floraDiseaseBiologyHomeostasisMedicineBioinformaticsFood scienceEndocrinologyBiochemistryInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Despite extensive research, current treatment of Parkinson's Disease (PD) remains symptomatic and disease modifying approaches are urgently required. A promising approach is to target the gut-brain-axis by modifying the intestinal microbiota and the herein produced metabolites. We decided to test this approach by modifying key metabolites of bacterial intestinal fermentation: short chain fatty acids (SCFA), known to be decreased in PD patients. A prospective, controlled pilot study was conducted in 11 couples, with one PD patient and healthy spouse as control (CO) each. Participants followed a 4-week diet rich in dietary fibre in addition to the intake of a prebiotic sirup (Lactulose). Metagenomes and metabolites of the gut microbiota, urinary metabolites and clinical characteristics were assessed. The short-term dietary intervention significantly augmented gastrointestinal SCFA production, likely associated with increased Bifidobacteria spp. PD associated gastrointestinal symptoms improved with increasing SCFA levels. The pre-existing bacterial dysbiosis associated with PD, such as depletion of genera Blautia, Dorea, and Erysipelatoclostridium in PD, persisted within the study period. Some pathobionts, i.e. Klebsiella, were reduced after the intervention. Bacterial metabolite composition (both faecal and urine metabolomes) shifted towards the composition of the healthy control in PD after the intervention. Among these brain-relevant gut metabolic functions improved in PD patients, such as S-Adenosyl methionine (SAM), 3,4-Dihydroxyphenylacetic acid (DOPAC), Glutathione (GSH), Tryptophan and inositol related changes, involved in neuroprotective and antioxidant pathways. Despite the small cohort size and short-term study period a minor dietary intervention was sufficient to improve gastrointestinal symptoms in PD and altered metabolic parameters in a presumed neuroprotective manner, warranting further investigation in larger cohorts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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