Early and gland-specific changes in gene expression in response to LPS-induced mastitis in a single quarter of Holstein cows
Notice bibliographique
Résumé
Abstract We previously reported changes in gene expression in mammary tissue from non-inflamed mammary glands adjacent to an inflamed gland challenged with lipopolysaccharide (LPS). We determined if changes in the expression of selected genes in non-inflamed glands would be replicated in RNA isolated from milk fat. Cows were milked twice daily prior to experiment. Per cow, one mammary gland (QLPS) was randomly assigned to receive an intramammary infusion of 50 µg LPS immediately after morning milking on d-0. The ipsilateral (QI) and contralateral (QC) mammary glands adjacent to QLPS remained untreated. Quarter foremilk samples from all mammary glands were collected on d-1 and d-0 for milk composition and isolation of RNA for quantification of selected genes via quantitative polymerase chain reaction. Symptoms of clinical mastitis developed only in QLPS and were apparent within 3 h post-challenge. In QI and QC, lactose percentages were lower at 12 h post-challenge compared to d-1, but milk fat and protein contents were not different. For gene expression, 7 of 13 selected genes were differentially regulated in non-inflamed glands. In QI but not QC, LALBA expression was lower at 12 h post-challenge than on d-1. One gene of interest, LPIN1, was significantly upregulated in QI and QC but downregulated in QLPS at 12 h post-challenge. Five additional immune or stress-related genes were significantly upregulated in QLPS and, to a lesser but significant degree, in QI and QC compared to d-1. Notably, expression of two immune genes (NFKBIA, PTX3) was significantly greater in QI than QC despite QI having a numerically lower somatic cell count. Minor changes in the composition of milk secreted by non-inflamed mammary glands were linked to several immune and stress responses in those glands. Further, individual non-inflamed mammary glands responded differently depending on their position relative to the mastitic gland.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».