MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4402459288 · doi:10.14440/bladder.2024.0016

Oral antimicrobial options for vancomycin-resistant Enterococcus isolates in urine culture

2024· article· en· W4402459288 sur OpenAlexaffabout
Roxanna S D Mohammed, Eugene Y. H. Yeung

Notice bibliographique

RevueBladder · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntimicrobial Resistance in Staphylococcus
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNitrofurantoinLinezolidAmpicillinVancomycinMicrobiologyEnterococcus faecalisEnterococcusEnterococcus faeciumCiprofloxacinFosfomycinMedicineTetracyclineAntimicrobialAntibioticsBiologyStaphylococcus aureusBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objectives: The present study aimed to investigate the susceptibility profiles of vancomycin-resistant Enterococcus isolates in urine culture to create an antibiogram to guide selection of oral antimicrobials in British Columbia (BC), Canada. Methods: An audit was conducted on all urine cultures reported from January 1, 2021, to December 31, 2023, in LifeLabs BC microbiology laboratories. Enterococcus species in urine were routinely tested with ampicillin, ciprofloxacin, nitrofurantoin, tetracycline, and vancomycin. Linezolid and fosfomycin were tested in selected cases. Results: Three hundred and thirty-five vancomycin-resistant Enterococcus faecium, 47 vancomycin-resistant Enterococcus faecalis, 48 Enterococcus gallinarum, 25 Enterococcus casseliflavus, and no Enterococcus flavescens isolates were reported in urine culture. Vancomycin-resistant E. faecium isolates were >90% susceptible to linezolid, but <15% susceptible to ampicillin, ciprofloxacin, nitrofurantoin, and tetracycline. Vancomycin-resistant E. faecalis isolates were >90% susceptible to ampicillin, linezolid, and nitrofurantoin, but <10% susceptible to ciprofloxacin and tetracycline. E. casseliflavus isolates were >90% susceptible to ampicillin, nitrofurantoin, and tetracycline. E. gallinarum isolates were >90% susceptible to ampicillin and nitrofurantoin. In the seven and 263 selected cases of vancomycin-resistant E. faecium and E. faecalis, respectively, fosfomycin susceptibility rates were 57% and 86%, respectively. Conclusions: Ampicillin and nitrofurantoin may be considered for urinary tract infections secondary to vancomycin-resistant E. faecalis, E. casseliflavus, and E. gallinarum. Tetracycline may also be considered for E. casseliflavus. Linezolid remained to be the only reliable oral antimicrobial for vancomycin-resistant E. faecium.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,649
Score d'incertitude au seuil0,949

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBladderMême sujetAntimicrobial Resistance in StaphylococcusTravaux en français237 207