MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4402472446 · doi:10.1101/2024.09.05.611330

Geographic characterization of RPE structure and lipid changes in the PEX1-p.Gly844Asp mouse model for Zellweger spectrum disorder

2024· preprint· en· W4402472446 sur OpenAlexaff
Samy Omri, Catherine Argyriou, Rachel S. Pryce, Erminia Di Pietro, Pierre Chaurand, Nancy Braverman

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePeroxisome Proliferator-Activated Receptors
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversité de MontréalMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésZellweger syndromePeroxisomal disorderBiologyRetinal degenerationRetinal pigment epitheliumRetinaPeroxisomeLipid metabolismRetinalCell biologyPathologyEndocrinologyGeneticsNeuroscienceMedicineBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Peroxisome Biogenesis Disorders-Zellweger Spectrum (PBD-ZSD) are a heterogenous group of autosomal recessive disorders caused by defects in PEX genes whose proteins are required for peroxisome assembly and function. Peroxisomes are ubiquitous organelles that play a critical role in complex lipid metabolism. Dysfunctional peroxisomes in ZSD cause multisystem effects, with progressive retinal degeneration (RD) leading to childhood blindness being one of the most frequent clinical findings. Despite progress in understanding the role of peroxisomes in normal cellular functions, much remains unknown about how their deficiency causes RD, and there is no treatment. To study RD pathophysiology in this disease, we used the knock-in PEX1-p.GlyG844Asp (G844D) mouse model of milder ZSD, which represents the common human PEX1-p.Gly843Asp allele. We previously reported diminished retinal function, functional vision, and neural retina structural defects in this model. Beyond the neural retina, structural defects in retinal pigment epithelium (RPE) have been reported in ZSD patients and murine models with single peroxisome enzyme deficiency, suggesting that RPE degeneration may contribute to overall RD progression in this disease. Here, we investigate the RPE phenotype in our PEX1-G844D mouse model, observing morphological, inflammatory, and lipid changes at 1, 3, and 6 months of age. We report that RPE cell degeneration appears at 3 months of age and worsens with time, starts in the dorsal pole, and is accompanied by subretinal inflammatory cell infiltration. We match these events with lipid remodelling using imaging mass spectrometry which allowed regional analysis specific to the RPE cell layer. We identified 47 lipid alterations that precede structural changes, 10 of which are localized to the dorsal pole. 32 of these lipid alterations persist to 3 months, with remodelling of the lipid signature at the dorsal pole. 14 new alterations occur concurrent with histological changes. Changes in peroxisome-dependent lipids detected by liquid chromatography tandem mass spectrometry (reduced docosahexanoic acid and increased very long chain lysophosphatidylcholines) are exacerbated over time. This study represents the first characterization of RPE in any animal model of ZSD, and the first in situ lipid analysis in any peroxisome-deficient tissue. Our findings reveal candidate lipid drivers that could be targeted to alleviate RD progression in ZSD, as well as candidate biomarkers that could be used to evaluate retinopathy progression and response to therapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0020,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,207
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)Même sujetPeroxisome Proliferator-Activated ReceptorsTravaux en français237 207