Mine yOur owN Anatomy: Revisiting Medical Image Segmentation With Extremely Limited Labels
Notice bibliographique
Résumé
Recent studies on contrastive learning have achieved remarkable performance solely by leveraging few labels in the context of medical image segmentation. Existing methods mainly focus on instance discrimination and invariant mapping (i.e., pulling positive samples closer and negative samples apart in the feature space). However, they face three common pitfalls: (1) tailness: medical image data usually follows an implicit long-tail class distribution. Blindly leveraging all pixels in training hence can lead to the data imbalance issues, and cause deteriorated performance; (2) consistency: it remains unclear whether a segmentation model has learned meaningful and yet consistent anatomical features due to the intra-class variations between different anatomical features; and (3) diversity: the intra-slice correlations within the entire dataset have received significantly less attention. This motivates us to seek a principled approach for strategically making use of the dataset itself to discover similar yet distinct samples from different anatomical views. In this paper, we introduce a novel semi-supervised 2D medical image segmentation framework termed Mine yOur owNAnatomy (MONA), and make three contributions. First, prior work argues that every pixel equally matters to the model training; we observe empirically that this alone is unlikely to define meaningful anatomical features, mainly due to lacking the supervision signal. We show two simple solutions towards learning invariances-through the use of stronger data augmentations and nearest neighbors. Second, we construct a set of objectives that encourage the model to be capable of decomposing medical images into a collection of anatomical features in an unsupervised manner. Lastly, we both empirically and theoretically, demonstrate the efficacy of our MONA on three benchmark datasets with different labeled settings, achieving new state-of-the-art under different labeled semi-supervised settings. MONA makes minimal assumptions on domain expertise, and hence constitutes a practical and versatile solution in medical image analysis. We provide the PyTorch-like pseudo-code in supplementary.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,008 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,003 |
| Communication savante | 0,002 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».