PSIII-25 Isolation of a deoxynivalenol (DON)-degrading microbial consortia from soil
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Mycotoxins, such as deoxynivalenol (DON) produced by Fusarium, are harmful fungal secondary metabolic products that cause economic losses and health risks to humans and livestock. Measures to control and prevent feed contamination with DON are necessary to ensure the safety of livestock. These include strategies based on preventing fungal contamination of feed or limiting contaminants in feed through mycotoxin adsorption and degradation. Soil is a valuable source of diverse microbial communities, potentially harboring DON-degrading bacteria that can be developed into feed additives to mitigate DON. This study aimed to identify microbial consortia from diverse soil samples, that could degrade DON. Soil from central (Lacombe; LA) and southern (Lethbridge; LE) Alberta were used as microbial inoculant. These soils were suspected to host Fusarium spp. which could produce DON in cereal crops growing upon them. The LE samples were further categorized into soil amended with manure (LE-MA) or non-manure (LE-UF). Prior to the study, soil pH and moisture content were measured. After soil collection, field-moist samples were mixed with DON-contaminated wheat (10% wt/wt; d 0) and each soil type was divided into triplicate pots and placed in a controlled environment for 32 d. On d 0, 7, 14 and 32, subsamples were collected from pots, serially diluted in a limited medium containing DON (10 µg/mL) as the only carbon source, and incubated for 2 wk (30°C). The degradation of DON in bacterial cultures was calculated using ELISA. The LA soil was slightly acidic (pH 6.4) compared with LE-MA (7.3) and LE-UF (pH 7.0), while moisture content was greater in LA (18.4%) than LE-MA (14.7%) and LE-UF (13.5%) soils. DON-degrading activity was only detected in LA soil samples and was greatest after 7 d of incubation (21%). We are currently isolating individual bacteria from LA soil for identification and are characterizing the soil microbiota using 16S rRNA sequencing. Overall, this study showed that soil contained bacteria capable of degrading DON, however variation existed depending on soil source.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».