MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4402533647 · doi:10.1093/jas/skae234.714

PSLBI-1 Stepwise approach applied to metabolites related to residual feed intake in Angus cattle

2024· article· en· W4402533647 sur OpenAlexaff
Alanne ório Ten Nunes, Francisco Novais, Camila A. Faleiros, Gabriela Marques Marcilli, Mirele Poleti, José Bento Sterman Ferraz, Heidge Fukumasu

Notice bibliographique

RevueJournal of Animal Science · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésResidual feed intakeAnimal scienceResidualBiologyBody weightMathematicsFeed conversion ratioEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Feed efficiency (FE) selection is crucial for improving the economic and environmental sustainability of beef cattle production. Residual feed intake (RFI) is the most commonly used parameter for FE because it is independent of metabolic body weight (MBW) and average daily gain (ADG). Low-RFI (LRFI) animals are more efficient, as they present less feed intake than expected, decreasing dry matter intake (DMI) and methane production per unit of body weight gain (BW). However, considering the time and resources required for RFI measurement, omics methods have been applied to distinguish between LRFI and high-RFI (HRFI) animals. This study performed a stepwise approach as an alternative for selecting important plasma metabolites related to RFI in beef cattle. Black Angus bulls (n = 64) with an initial BW of 321.8 ± 59.98 kg and 12.9 ± 1.08 mo from rearing under continuous grazing were allocated to feedlot pens and fed a diet containing 80:20 roughage:concentrate. The animals were evaluated for DMI and BW using an integrated real-time data collection system (Intergado, Brazil) for 56 d, and ADG was estimated as the slope of the linear regression between BW and days on feed. Blood samples were collected at the end of the finishing phase by puncturing the coccygeal vessels. Through targeted metabolomics, concentrations of plasma amino acids, biogenic amines, and hexoses were determined using an AB Sciex 5500 QTRAP mass spectrometer in liquid chromatography-mass-spectrometry and flow-injection analysis mode. The fixed effect of MBW, ADG, age and batch, and the random effect of sire were considered in the mixed model to determine RFI and to categorize the 20 greatest and 20 least values as HRFI and LRFI, respectively, using the lmer4 R package. A stepwise approach in both directions was used in the MASS R package. The model with the lowest AIC (31.15) presented 23 of the 31 metabolites, followed by ANOVA (Table 1). Serotonin, glutamate, phenylalanine, and tyrosine concentrations were greater in HRFI, whereas aspartate, citrulline, tryptophan, ornithine, taurine, creatinine, and trans-4-hydroxyproline concentrations were greater in LRFI (P < 0.05). The gluconeogenic potential of glutamate, phenylalanine, and tyrosine suggests that an impact on energy availability may affect DMI. Conversely, differences in creatinine and trans-4-hydroxyproline abundance can reflect changes in muscular body mass, while the greater concentrations of aspartate, citrulline, and ornithine in LRFI animals suggest that a lower DMI can be associated with lower urea cycle activity. The stepwise approach appears to be a feasible alternative as a pre-selection method to identify plasma metabolites that could be used to categorize beef cattle for RFI. Further validation is required to confirm the potential of these metabolites as biomarkers for FE selection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Animal Science→Même sujetGenetic and phenotypic traits in livestock→Travaux en français237 207→