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Enregistrement W4402557026 · doi:10.17975/sfj-2024-012

A review on single-cell analysis of macrophages in cancer

2024· review· en· W4402557026 sur OpenAlexvenueno aff
Isaiah Yim, Amirali Assylkhan

Notice bibliographique

RevueSTEM Fellowship Journal · 2024
Typereview
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune cells in cancer
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCancer cellCellCancerCancer researchChemistryMedicineInternal medicineBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cancer is characterized by uncontrolled cell growth and spread into surrounding tissue. According to the North American Association of Central Cancer Registries (NAACCR) and the National Center for Health Statistics, there were 1,918,030 cancer cases and a total of 609,360 deaths estimated in the US in 2022. Although the direct cause of cancer is not fully understood, it is recognized that the immune system plays a major role in the development and progression of tumors. Investigating tumor-associated macrophages (TAMs) is crucial for understanding the immunosuppressive role that they may play in the tumor microenvironment, which makes them a target for immunotherapies to combat cancer. However, angiogenesis, tumor initiation and invasion promoting signals prevent gaining deeper insight into the intricate molecular mechanisms involved in TAMs and the tumor microenvironment. While researchers in the past have used population samples to analyze cells, recent efforts have incorporated single-cell technologies to study the complex mixture of cells in a tumor, monitor the effects of immunotherapies and more. With the revolutionary advent of the first single-cell RNA sequencing (scRNA-seq), researchers have since been able to gain insight into single-cell data with unprecedented accuracy and develop new immunotherapies through different single-cell technologies, such as polymethylsiloxane (PDMS) and Multiplexed Ion Beam Imaging (MIBI) multiplexing. In this review, we underline the benefits of adopting single-cell technologies to identify distinct cell types in complex environments (i.e., tumors) and highlight the potential application of these technologies along with various multiplexing techniques to immunotherapies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,849
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,002
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,082
Tête enseignante GPT0,366
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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