Person-level contributions of bipolar polygenic risk score to the prediction of new-onset bipolar disorder in at-risk offspring
Notice bibliographique
Résumé
Previous work indicates that polygenic risk scores (PRS) for bipolar disorder (BD) are elevated in adults and youth with BD, but whether BD-PRS can inform person-level diagnostic prediction is unknown. Here, we test whether BD-PRS improves performance of a previously published risk calculator (RC) for BD. 156 parents with BD-I/II and their offspring ages 6–18 were recruited and evaluated with standardized diagnostic assessments every two years for >12 years. DNA was extracted from saliva samples, genotyping performed, and BD-PRS calculated based on a 2021 meta-analysis. Using a bootstrapped and cross-validated penalized Cox regression, we assessed whether BD-PRS (alone and interacting with clinical variables) improved RC performance. Of 227 offspring, 38 developed BD during follow-up. The penalized regression selected BD-PRS and interactions between BD-PRS and parental age at mood disorder onset (AAO), depression, and anxiety. The resulting RC discriminated offspring who developed BD (vs. those that did not) with good accuracy (AUC = 0.81); removing BD-PRS and its interaction terms was associated with a significant decrement to the AUC (decrement = 0.07, p = 0.039). Further exploration of selected interaction terms indicated that all were significant ( p -values<0.02), indicating that BD-PRS has a larger effect on the outcome in offspring with depression and anxiety, whose affected parent had a younger AAO. The addition of BD-PRS to clinical/demographic predictors in the RC significantly improved its accuracy. BD-PRS predicted BD on the person-level, particularly in offspring of parents with earlier AAO who already had symptoms of anxiety and depression at intake. • Polygenic risk score for BD is elevated in those with BD, but its contributions to person-level prediction are unknown. • We tested whether the addition of BD-PRS to a previously published risk calculator improves prediction. • The addition of BD-PRS to the risk calculator improved prediction accuracy, especially in symptomatic youth. • Although BD-PRS explains a limited amount of variance, it adds to clinical factors to improve person-level prediction.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,009 | 0,014 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,003 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».