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Enregistrement W4402563739 · doi:10.1101/2024.09.17.24313808

Surveillance and control of neglected zoonotic diseases: methodological approaches to studying Rift Valley Fever, Crimean-Congo Haemorrhagic Fever and Brucellosis at the human-livestock-wildlife interface across diverse agricultural systems in Uganda

2024· preprint· en· W4402563739 sur OpenAlexfundno aff
Dennison Kizito, Sam Tweed, Joseph Mutyaba, Nackson Babi, Swaib A. Lule, Gladys Nakanjako Kiggundu, Rory Gibb, Charity Angella Nassuna, Ronald Ssali Ogwal, Ebenezer Paul, Mercy Haumba, Collins Agaba, Phionah Katushabe, Eric Enyel, Stephen Balinandi, Lydia H. V. Franklinos, Naomi Fuller, Leah A. Owen, Laura V. Ferguson, Deo Birungi Ndumu, Musa Sekammatte, Patrick Atimnedi, Luke Nyakarahuka, Gladys Kalema‐Zikusoka, Ibrahim Abubakar, Nigel Field, Janet Seeley, Julius J. Lutwama

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral Infections and Vectors
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInternational Development Research Centre
Mots-clésRift Valley feverBrucellosisLivestockGeographyZoonosisWildlifeAgricultureCrimean–Congo hemorrhagic feverAgroforestryVirologyBiologyEcologyOutbreak

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Zoonoses are of public health importance, with most major emerging diseases originating in animal populations. Rift Valley Fever (RVF), Crimean-Congo Haemorrhagic Fever (CCHF) and Brucellosis are circulating in Uganda, causing frequent outbreaks, but gaps exist in the understanding of transmission dynamics, community perspectives and effective mitigation strategies of these diseases. With increasing human-livestock-wildlife interaction in Uganda’s biodiverse cattle corridor, this study protocol outlines an integrated One Health model to determine the burden of RVF, CCHF and Brucellosis, identify key vectors and reservoirs and assesses the impact of social and policy factors on disease distribution. Methods A series of mixed-methods cross-sectional and longitudinal surveys across six conservation areas experiencing high human-livestock-wildlife interaction spanning Uganda’s Cattle Corridor: Queen Elizabeth National Park, Bwindi-Mgahinga Impenetrable Forest, Lake Mburo-Nakivaale, Murchison Falls, Kidepo Valley and Pian Upe Game Reserve. In selected villages, household surveys comprise questionnaires, focus-group discussions and in-depth interviews to determine drivers of disease risk with blood-sampling of human population. Questionnaires provide details on livestock practices, and blood sampling is conducted on cattle, sheep, pigs and goats. Targeted sampling of vectors in these localities, including mosquitoes, ticks and small mammals, using environmental traps and on-host collection. Specimens taken from nearby large wildlife include blood sampling and nasal swabs. Serological testing using indirect ELISA and molecular testing using real-time PCR was conducted to determine disease status of RVF, CCHF and Brucellosis across humans, livestock and wildlife with eco-epi modelling and qualitative analyses used to inform risks and drivers of disease. Results Baseline survey data and blood specimens were obtained from 2894 humans residing in 1602 households across 96 villages in 6 conservation areas of Uganda. A further 379 community members participated in focus group discussions and key informant interviews with 978 reformed and active poachers across 4 conservation areas. 3692 livestock were sampled, including 1925 cattle, 1409 goats, 282 sheep and 76 pigs from 358 herds. Vector data were collected for 18236 ticks, 53480 mosquitoes and 612 rodents. 241 large wildlife were sampled, including buffalo, kobs, zebras, waterbucks, topi and hartebeest. 127 Community One Health Volunteers (COHVs) were enlisted to monitor and detect outbreaks in the study sites. Conclusions This paper outlines a comprehensive One Health approach to studying neglected zoonotic diseases, integrating molecular epidemiology, social sciences and community participatory approaches involving humans, livestock, vectors and wildlife across 6 conservation areas in Uganda. It will inform interventions to enhance the surveillance and control of RVF, CCHF and Brucellosis, including strengthening outbreak preparedness and response.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,097
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,129
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,097
Score d'incertitude au seuil0,511

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0970,129
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0050,004
Études des sciences et des technologies0,0030,003
Communication savante0,0040,002
Science ouverte0,0020,005
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,174
Tête enseignante GPT0,347
Écart entre enseignants0,173 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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