Mint/X11 PDZ domains from non-bilaterian animals recognize and bind CaV2 calcium channel C-termini in vitro
Notice bibliographique
Résumé
Abstract PDZ domain mediated interactions with voltage-gated calcium (Ca V ) channel C-termini play important roles in localizing membrane Ca 2+ signaling. The first such interaction was described between the scaffolding protein Mint-1 and Ca V 2.2 in mammals. In this study, we show through various in silico analyses that Mint is an animal-specific gene with a highly divergent N-terminus but a strongly conserved C-terminus comprised of a phosphotyrosine binding domain, two tandem PDZ domains (PDZ-1 and PDZ-2), and a C-terminal auto-inhibitory element that binds and inhibits PDZ-1. In addition to Ca V 2 chanels, most genes that interact with Mint are also deeply conserved including amyloid precursor proteins, presenilins, neurexin, and CASK and Veli which form a tripartite complex with Mint in bilaterians. Through yeast and bacterial 2-hybrid experiments, we show that Mint and Ca V 2 channels from cnidarians and placozoans interact in vitro, and in situ hybridization revealed co-expression in dissociated neurons from the cnidarian Nematostella vectensis . Unexpectedly, the Mint orthologue from the ctenophore Hormiphora californiensis strongly bound the divergent C-terminal ligands of cnidarian and placozoan Ca V 2 channels, despite neither the ctenophore Mint, nor the placozoan and cnidarian orthologues, binding the ctenophore Ca V 2 channel C-terminus. Altogether, our analyses suggest that the capacity of Mint to bind Ca V 2 channels predates bilaterian animals, and that evolutionary changes in Ca V 2 channel C-terminal sequences resulted in altered binding modalities with Mint.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».