Comparison of Roka Atlas® System Performance and Health Canada Reference Method for <i>Listeria</i> Detection From Plastic, Sealed Concrete, and Stainless-Steel Surface Samples
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: There is a high demand in the food industry and in public health for rapid automated methods capable of high-volume sample processing. OBJECTIVE: In an unpaired study, Roka Atlas® System performance was compared with Health Canada reference method MFHPB-30 for Listeria spp. (LSP Roka assay) and Listeria monocytogenes (LmG2 Roka Assay) detection on plastic (PL), sealed concrete (SC), and stainless-steel (SS) surfaces (45 samples each per candidate or reference method). METHODS: Seeking shorter enrichment time for the candidate method, R2 medium pre-enrichment for 14, 16, and 24 h at 35°C was combined with the Roka assay. Listeria welshimeri, L. innocua, and L. monocytogenes were employed to individually inoculate each of the three surfaces, with two competing microorganisms within the 10-100-fold higher concentration range. RESULTS: False negative, false positive, sensitivity, and specificity were 0, 0, 100, and 100%, respectively, for the plastic, sealed concrete, and stainless-steel surfaces, regardless of inoculation level (high, low, and uninoculated) and enrichment time. Candidate method detected 10, 7, and 9 true positives, versus 10, 6, and 10 by the reference method in individually inoculated SS, PL, and SC, respectively. CONCLUSIONS: Probability of detection for all the three surfaces for the Roka Atlas System was comparable to the reference method in this unpaired study. HIGHLIGHTS: The Roka Atlas System detected targets after as little as 14 h enrichment. Surface type did not negatively affect assay sensitivity or specificity. The Roka Atlas System was comparable to the reference method.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».