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Enregistrement W4402620626 · doi:10.1016/j.pbi.2024.102626

New frontiers in the biosynthesis of psychoactive specialized metabolites

2024· review· en· W4402620626 sur OpenAlexafffund
Ginny Li, Peter J. Facchini

Notice bibliographique

RevueCurrent Opinion in Plant Biology · 2024
Typereview
Langueen
DomainePsychology
ThématiquePsychedelics and Drug Studies
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGovernment of Alberta
Mots-clésPsilocybinMescalineLysergic acid diethylamideLysergic acidHallucinogenBiologyTryptaminePharmacologyBiochemistrySerotonin

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The recent relaxation of psychedelic drug regulations has prompted extensive clinical investigation into their potential use to treat diverse mental health conditions including anxiety, depression, post-traumatic stress, and substance-abuse disorders. Most clinical trials have relied on a small number of known molecules found in nature, such as psilocybin, or long-known synthetic analogs of natural metabolites, including lysergic acid diethylamide (LSD). Elucidation of biosynthetic pathways leading to several psychedelic compounds has established an opportunity to use synthetic biology as a complement to synthetic chemistry for the preparation of novel derivatives with potentially superior pharmacological properties compared with known drugs. Herein we review the metabolic biochemistry of pathways from plants, fungi and animals that yield the medicinally important hallucinogenic specialized metabolites ibogaine, mescaline, psilocybin, lysergic acid, and N,N-dimethyltryptamine (DMT). We also summarize the reconstitution of these pathways in microorganisms and comment on the integration of native and non-native enzymes to prepare novel derivatives.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,183
Tête enseignante GPT0,461
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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