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Enregistrement W4402635352 · doi:10.1101/2024.09.15.613155

DNA polymerase theta-mediated DNA repair is a functional dependency and therapeutic vulnerability in DNMT3A deficient leukemia cells

2024· preprint· en· W4402635352 sur OpenAlexafffund
Bac Viet Le, Umeshkumar Vekariya, Monika M. Toma, Margaret Nieborowska-Skorska, Marie‐Christine Caron, Malgorzata Gozdecka, Zayd Haydar, Martin J. Walsh, Jayashri Ghosh, Elaine Vaughan‐Williams, Paulina Podszywalow‐Bartnicka, Anna-Mariya Kukuyan, Sylwia Ziółkowska, Emir Hadzijusufovic, Gurushankar Chandramouly, Katarzyna Piwocka, Richard T. Pomerantz, George S. Vassiliou, Brian J.P. Huntly, Peter Valent, Alfonso Bellacosa, Jean‐Yves Masson, Gaorav P. Gupta, Grant A. Challen, Tomasz Skórski

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensHôpital de l'Enfant-Jésus
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthCanadian Institutes of Health ResearchEdward P. Evans FoundationBlood Cancer UKLeukemia and Lymphoma Society
Mots-clésDNA damageDNA polymeraseBiologyCancer researchDNA replicationLeukemiaMyeloid leukemiaMolecular biologyDNAGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Myeloid malignancies carrying somatic DNMT3A mutations (DNMT3Amut) are usually resistant to standard therapy. DNMT3Amut leukemia cells accumulate toxic DNA double strand breaks (DSBs) and collapsed replication forks, rendering them dependent on DNA damage response (DDR). DNA polymerase theta (Polθ), a key element in Polθ-mediated DNA end-joining (TMEJ), is essential for survival and proliferation of DNMT3Amut leukemia cells. Polθ is overexpressed in DNMT3Amut leukemia cells due to abrogation of PARP1 PARylation-dependent UBE2O E3 ligase-mediated ubiquitination and proteasomal degradation of Polθ. In addition, PARP1-mediated recruitment of the SMARCAD1-MSH2/MSH3 repressive complex to DSBs was diminished in DNMT3Amut leukemia cells which facilitated loading of Polθ on DNA damage and promoting TMEJ and replication fork restart. Polθ inhibitors enhanced the anti-leukemic effects of mainstream drugs such as FLT3 kinase inhibitor quizartinib, cytarabine and etoposide in vitro and in mice with FLT3(ITD);DNMT3Amut leukemia. Altogether, Polθ is an attractive target in DNMT3Amut hematological malignancies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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