<i>De novo</i> variant analysis of childhood-onset obsessive-compulsive disorder in the French-Canadian population
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Childhood-onset obsessive-compulsive disorder (OCD) is a neuropsychiatric disorder with a strong genetic component. De novo variants (DNVs) have been shown to have a role in childhood-onset OCD, but to date, no DNV analysis has been performed in patients from a genetically isolated population. Here, we aimed to investigate the impact of rare de novo single nucleotide variants (dnSNVs) on childhood-onset OCD risk in the French-Canadian population. In a cohort of 36 French-Canadian trios comprised of 36 probands with childhood-onset OCD and 72 unaffected parents, we identified 34 dnSNVs harboured in 34 different genes. We found that four of these genes were previously associated with OCD, replicating their contribution to its risk. We also observed complete overlap between our 34 candidate genes and genes associated with 11 related neuropsychiatric disorders, supporting a shared underlying genetic susceptibility across psychopathologies. Among genes harbouring DNVs across three childhood-onset OCD cohorts, we observed an overrepresentation of genes involved in clathrin-dependent endocytosis (GO:0072583; p-adj = 0.0498) and phosphatidylinositol binding (GO:0035091; p-adj = 0.0431), offering potential biological mechanisms underlying childhood-onset OCD. No association was found between the number of dnSNVs in childhood-onset OCD probands and OCD symptom severity. Altogether, this study offers a framework for performing DNV analyses of complex disorders in genetically isolated populations. We have provided the first list of candidate childhood-onset OCD genes in the French-Canadian population.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».