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Enregistrement W4402664387 · doi:10.22541/au.172683414.46934751/v1

Evidence for variation in the genetic basis of sex determination in brook stickleback ( Culaea inconstans )

2024· preprint· en· W4402664387 sur OpenAlexaff
Grace C. Pigott, Massa Abo Akel, Malcolm G. Q. Rogers, Marin E. Flanagan, Erica G. Marlette, Matthew J. Treaster, Shannon K. Fox, Shaughnessy McCann, Michael A. White, Daniel L. Jeffries, Jonathan A. Mee

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Clinical Aspects of Sex Determination and Chromosomal Abnormalities
Établissements canadiensMount Royal University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSticklebackVariation (astronomy)BiologyGenetic variationZoologyEvolutionary biologyEcologyFisheryFish <Actinopterygii>GeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The genetic basis of sex determination is typically conserved within species if not within broader lineages. For example, within the stickleback family (Gasterosteidae), AmhY has been identified as a master sex-determination (MSD) gene in multiple species across two genera. By constrast, the existence of within-species variability in the genetic basis of sex determination is not frequently observed but provides an opportunity to understand the evolution and turnover of sex determination systems. In this study, we investigated the consistency with which AmhY is involved in sex determination across 610 individuals from five brook stickleback ( Culaea inconstans ) populations. We designed a PCR-restriction enzyme assay to identify the presence of AmhY in each individual and recorded sexual morphology in each individual in the field at the time of capture. We found that the genetic sex (presence/absence of AmhY) did not match the field-determined phenotypic sex in up to 27% of individuals within a population. This variation in the genetic basis of sex determination in brook stickleback suggests that the mechanism of sex determination in this species is likely more complex than thought when AmhY was first implicated and may still be evolving. Such within-species variation provides an opportunity to further investigate how and why transitions in sex-determination mechanisms occur.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,324
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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