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Enregistrement W4402665060 · doi:10.3103/s0095452724050025

Targeted Sequencing of HEXA Gene Shows Missense Substitution (p.Arg499His) in a Large Pakistani Family with Tay-Sachs Disease

2024· article· en· W4402665060 sur OpenAlexaff
Fariya Khan Bazai, Mehmood Ul Hassan, Hani Tayyab, Sara Naudhani, Sami Siraj, Muhammad Tariq, Sajjad Ali Shah, Jamil Ahmad, Shakeela Daud

Notice bibliographique

RevueCytology and Genetics · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLysosomal Storage Disorders Research
Établissements canadiensMontreal Neurological Institute and HospitalMcGill UniversityMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHEXAMissense mutationTay-Sachs diseaseGeneticsGeneSubstitution (logic)BiologyDNA sequencingDiseaseMutationMedicinePhilosophyBiochemistryInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Tay-Sachs disease or GM2 gangliosidosis, is caused by a deficiency of beta-hexosaminidase A (HEXA), resulting in lysosomal accumulation of GM2 ganglioside. However, deficiencies or reduced activities of HEXA and HEXB result in Sandhoff disease. The patients manifest with the macular cherry-red spots due to lipid-laden ganglion cells, hypotonia, low muscle tone, intractable seizures, developmental arrest, blindness, and neurological deterioration. The aim of this study was to identify the TSD-causing variant in a large Pakistani family showing typical symptoms of Tay-Sachs disease. Here, we studied a large Pakistani family with six TSD patients for the identification of the pathogenic variant by targeted DNA sequencing. As a result, we identified a missense substitution (p.Arg499His) in exon 13 of HEXA that was completely cosegregated among affected and normal individuals. In conclusion, we identified a missense substitution (p.Arg499His) in HEXA gene in a large consanguineous Pakistani family and further enriched the mutational spectrum of HEXA through Pakistani patients for the early diagnosis of the disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,362
Score d'incertitude au seuil0,490

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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