Protocol to monitor live-cell, real-time, mitochondrial respiration in mouse muscle cells using the Resipher platform
Notice bibliographique
Résumé
Mitochondrial function is typically assessed by measuring oxygen consumption at a given time point. However, this approach cannot monitor respiratory changes that occur over time. Here, we present a protocol to measure mitochondrial respiration in freshly isolated muscle stem cells, primary skeletal muscle, and immortalized C2C12 myoblasts in real time using the Resipher platform. We describe steps for preparing and plating cells, performing media changes, setting up the software and device, and analyzing data. This method can be adapted to other cell types. For complete details on the use and execution of this protocol, please refer to Triolo et al. 1 • Protocol to measure cellular oxygen consumption in real time using Resipher • Procedures for culturing myoblasts and muscle stem cells to assess oxygen consumption • Instructions to quantify and represent oxygen consumption data Publisher’s note: Undertaking any experimental protocol requires adherence to local institutional guidelines for laboratory safety and ethics. Mitochondrial function is typically assessed by measuring oxygen consumption at a given time point. However, this approach cannot monitor respiratory changes that occur over time. Here, we present a protocol to measure mitochondrial respiration in freshly isolated muscle stem cells, primary skeletal muscle, and immortalized C2C12 myoblasts in real time using the Resipher platform. We describe steps for preparing and plating cells, performing media changes, setting up the software and device, and analyzing data. This method can be adapted to other cell types.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,005 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,055 | 0,040 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».