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Enregistrement W4402668779 · doi:10.1016/j.crfs.2024.100855

NMR metabolomics of plant and yeast-based hydrolysates for cell culture media applications — A comprehensive assessment

2024· article· en· W4402668779 sur OpenAlexafffund
Michelle Combe, Kathy Sharon Isaac, Greg Potter, Stanislav Sokolenko

Notice bibliographique

RevueCurrent Research in Food Science · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueViral Infectious Diseases and Gene Expression in Insects
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesDalhousie UniversityNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGood Food InstituteGourmet Foods International
Mots-clésMetabolomicsYeastHydrolysateChemistryBiotechnologyComputational biologyBiologyChromatographyBiochemistryHydrolysis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cultivated meat products, generated by growing isolated skeletal muscle and fat tissue, offer the promise of a more sustainable and ethical alternative to traditional meat production. However, with cell culture media used to grow the cells accounting for 55-95% of the overall production cost, achieving true sustainability requires significant media optimization. One means of dealing with these high costs is the use of low-cost complex additives such as hydrolysates to provide a wide range of nutrients, from small molecules (metabolites) to growth factors and peptides. Despite their potential, most hydrolysate products remain poorly characterized and many are thought to suffer from persistent issues of high batch-to-batch variability. Although there have been a number of isolated efforts to determine metabolic profiles for a handful of hydrolysate products, we present the first attempt at a more comprehensive metabolomic characterization of nine different products (four plant and five yeast-based) from two to four different lots each. NMR analysis identified 90 unique metabolites, with only 15 metabolites common to all hydrolysate products (including eight of the nine essential amino acids), and 16 metabolites found in only a single hydrolysate product. The different hydrolysate products were found to have substantial differences in metabolite concentrations (as a fraction of overall mass), ranging from a high of 43% in yeast extract to a low of 14% in soy hydrolysates. The proportion of various metabolites also varied between products, with carbohydrate concentrations particularly high in soy hydrolysates and nucleosides more prominent in two of the yeast products. Overall, yeast extract generally had higher metabolite concentrations than all the other products, whereas both yeast extract and cotton had the largest variety of metabolites. A direct calculation of batch-to-batch variability revealed although there are significant differences between lots, these are largely driven by a relatively small fraction of compounds. This report will hopefully serve as a useful starting point for a more nuanced consideration of hydrolysate products in cell culture media optimization, both in the context of cultivated meat and beyond.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,201
Score d'incertitude au seuil0,266

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,070
Tête enseignante GPT0,410
Écart entre enseignants0,339 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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