The plasmid-borne <i>hipBA</i> operon of <i>Klebsiella michiganensis</i> encodes a potent plasmid stabilization system
Notice bibliographique
Résumé
AIMS: Klebsiella michiganensis is a medically important bacterium that has been subject to relatively little attention in the literature. Interrogation of sequence data from K. michiganensis strains in our collection has revealed the presence of multiple large plasmids encoding type II toxin-antitoxin (TA) systems. Such TA systems are responsible for mediating a range of phenotypes, including plasmid stability ('addiction') and antibiotic persistence. In this work, we characterize the hipBA TA locus found within the Klebsiella oxytoca species complex (KoSC). METHODS AND RESULTS: The HipBA TA system is encoded on a plasmid carried by K. michiganensis PS_Koxy4, isolated from an infection outbreak. Employing viability and plasmid stability assays, we demonstrate that PS_Koxy4 HipA is a potent antibacterial toxin and that HipBA is a functional TA module contributing substantially to plasmid maintenance. Further, we provide in silico data comparing HipBA modules across the entire KoSC. CONCLUSIONS: We provide the first evidence of the role of a plasmid-encoded HipBA system in stability of mobile genetic elements and analyse the presence of HipBA across the KoSC. These results expand our knowledge of both a common enterobacterial TA system and a highly medically relevant group of bacteria.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».