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Enregistrement W4402686107 · doi:10.1002/ana.27077

Loss‐of‐Function Variants in <scp><i>CUL3</i></scp> Cause a Syndromic Neurodevelopmental Disorder

2024· article· en· W4402686107 sur OpenAlexaff
Patrick R. Blackburn, Frédéric Ebstein, Tzung‐Chien Hsieh, Marialetizia Motta, Francesca Clementina Radio, Johanna C. Herkert, Tuula Rinne, Isabelle Thiffault, Michele Rapp, Mariel Alders, Saskia M. Maas, Bénédicte Gérard, Thomas Smol, Catherine Vincent‐Delorme, Benjamin Cogné, Bertrand Isidor, Marie Vincent, Ruxandra Bachmann‐Gagescu, Anita Rauch, Pascal Joset, Giovanni Battista Ferrero, Andrea Ciolfi, Thomas Husson, Anne‐Marie Guerrot, Carlos A. Bacino, Colleen Macmurdo, Stephanie S. Thompson, Jill A. Rosenfeld, Laurence Faivre, Frédéric Tran Mau‐Them, Wallid Deb, Virginie Vignard, Pankaj B. Agrawal, Jill A. Madden, Alice Goldenberg, François Lecoquierre, Michael Zech, Holger Prokisch, Ján Necpál, Robert Jech, Juliane Winkelmann, Monika Turčanová Koprušáková, Vassiliki Konstantopoulou, John R. Younce, Marwan Shinawi, Chloe Mighton, Charlotte Fung, Chantal F. Morel, Jordan Lerner‐Ellis, Stephanie DiTroia, Magalie Barth, Dominique Bonneau, Ingrid P.C. Krapels, Alexander P.A. Stegmann, Vyne van der Schoot, Theresa Brunet, Cornelia Bußmann, Cyril Mignot, Giuseppe Zampino, Saskia B. Wortmann, Johannes A. Mayr, René G. Feichtinger, Thomas Courtin, Claudia Ravelli, Boris Keren, Alban Ziegler, Linda Hasadsri, Pavel N. Pichurin, Eric W. Klee, Katheryn Grand, Pedro A. Sanchez‐Lara, Elke Krüger, Stéphane Bezieau, Hannah Klinkhammer, Peter Krawitz, Evan E. Eichler, Marco Tartaglia, Sébastien Küry, Tianyun Wang

Notice bibliographique

RevueAnnals of Neurology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai HospitalSinai Health SystemUniversity Health NetworkUniversity of TorontoSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental HealthNational Natural Science Foundation of ChinaFundamental Research Funds for the Central UniversitiesNational Institutes of HealthAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésUbiquitin ligaseLoss functionMissense mutationUbiquitinPhenotypeBiologyGeneticsHaploinsufficiencyIntellectual disabilityGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: De novo variants in cullin-3 ubiquitin ligase (CUL3) have been strongly associated with neurodevelopmental disorders (NDDs), but no large case series have been reported so far. Here, we aimed to collect sporadic cases carrying rare variants in CUL3, describe the genotype-phenotype correlation, and investigate the underlying pathogenic mechanism. METHODS: Genetic data and detailed clinical records were collected via multicenter collaboration. Dysmorphic facial features were analyzed using GestaltMatcher. Variant effects on CUL3 protein stability were assessed using patient-derived T-cells. RESULTS: We assembled a cohort of 37 individuals with heterozygous CUL3 variants presenting a syndromic NDD characterized by intellectual disability with or without autistic features. Of these, 35 have loss-of-function (LoF) and 2 have missense variants. CUL3 LoF variants in patients may affect protein stability leading to perturbations in protein homeostasis, as evidenced by decreased ubiquitin-protein conjugates in vitro. Notably, we show that 4E-BP1 (EIF4EBP1), a prominent substrate of CUL3, fails to be targeted for proteasomal degradation in patient-derived cells. INTERPRETATION: Our study further refines the clinical and mutational spectrum of CUL3-associated NDDs, expands the spectrum of cullin RING E3 ligase-associated neuropsychiatric disorders, and suggests haploinsufficiency via LoF variants is the predominant pathogenic mechanism. ANN NEUROL 2024.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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