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Enregistrement W4402693911 · doi:10.1136/jcp-2024-209643

Assessment of AI-based computational H&E staining versus chemical H&E staining for primary diagnosis in lymphomas: a brief interim report

2024· article· en· W4402693911 sur OpenAlexaff
Rima Koka, Laura Wake, Nam K Ku, Kathryn Rice, Autumn LaRocque, Elba Vidal, Serge Alexanian, Raymond Kozikowski, Yair Rivenson, Michael E. Kallen

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Pathology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueAI in cancer detection
Établissements canadiensTellabs (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésConcordanceMedical diagnosisStainLymph nodePathologyMedicineStainingHistologyDigital pathologyTelepathologyChemical pathologyDifferential diagnosisRadiologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Microscopic review of tissue sections is of foundational importance in pathology, yet the traditional chemistry-based histology laboratory methods are labour intensive, tissue destructive, poorly scalable to the evolving needs of precision medicine and cause delays in patient diagnosis and treatment. Recent AI-based techniques offer promise in upending histology workflow; one such method developed by PictorLabs can generate near-instantaneous diagnostic images via a machine learning algorithm. Here, we demonstrate the utility of virtual staining in a blinded, wash-out controlled study of 16 cases of lymph node excisional biopsies, including a spectrum of diagnoses from reactive to lymphoma and compare the diagnostic performance of virtual and chemical H&Es across a range of stain quality, image quality, morphometric assessment and diagnostic interpretation parameters as well as proposed follow-up immunostains. Our results show non-inferior performance of virtual H&E stains across all parameters, including an improved stain quality pass rate (92% vs 79% for virtual vs chemical stains, respectively) and an equivalent rate of binary diagnostic concordance (90% vs 92%). More detailed adjudicated reviews of differential diagnoses and proposed IHC panels showed no major discordances. Virtual H&Es appear fit for purpose and non-inferior to chemical H&Es in diagnostic assessment of clinical lymph node samples, in a limited pilot study.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,016
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,027
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,086

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0160,027
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,128
Tête enseignante GPT0,482
Écart entre enseignants0,353 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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