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Enregistrement W4402694369 · doi:10.1101/2024.09.16.611828

An accessible platform to quantify oxygen diffusion in cell-laden hydrogels and its application to alginate-immobilized pancreatic beta cells

2024· preprint· en· W4402694369 sur OpenAlexaff
Kurtis Champion, Hamid Ebrahimi Orimi, Laurier Gauvin, Jonathan A. Brassard, Berit L. Strand, Richard L. Leask, Corinne A. Hoesli

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic function and diabetes
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSelf-healing hydrogelsDiffusionBETA (programming language)ChemistryOxygenBiomedical engineeringChemical engineeringComputer sciencePolymer chemistryEngineeringPhysicsThermodynamicsOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Hydrogels are commonly used to immobilize mammalian cells, serving various purposes such as providing mechanical cues in three-dimensional cultures and acting as barriers for immunoprotection in transplantation. For instance, islet encapsulation holds promise in delivering insulin-producing cells for diabetes cellular therapy. Cell immobilization, by creating a barrier to bulk fluid motion, leads to diffusion-limited molecular transport and concentration gradients of nutrients such as oxygen being consumed by the immobilized cells. Oxygen mass transport models aid in designing immobilization strategies but rely on input parameters like oxygen diffusivity, often assumed rather than experimentally measured due to limited resources or expertise. We propose an accessible, cost-effective, and easy to operate system to experimentally determine the diffusion coefficient of cell-laden hydrogels, with application tested to alginate-immobilized pancreatic beta cell (MIN6). As compared to water, the oxygen diffusion coefficient was significantly reduced in alginate gels. The oxygen diffusion coefficient was inversely correlated with the dynamic loss modulus for gels with similar chemical composition, and significantly reduced when the alginate concentration was increased from 2% to 5%. The viability of immobilized MIN6 cells was highly dependent both on gel concentration and cell density, as predicted by Thiele modulus and effectiveness factor values calculated from measured oxygen diffusion coefficients. The proposed platform, combining a simple experimental setup and the use of dimensionless numbers, offers a straightforward means to predict maximal diffusion distances in cell immobilization strategies. This platform can be implemented in the rational design of cell encapsulation, immobilized cell culture, and tissue engineering strategies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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