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Enregistrement W4402696071 · doi:10.1016/j.cbpa.2024.111747

Commentary: Best practices for performing olfactory behavioral assays on aquatic animals: A guide for comparative physiologists

2024· review· en· W4402696071 sur OpenAlexafffund
Cosima S. Porteus, Elissa Khodikian, Liam R. Tigert, Gary J. Ren, Gwangseok R. Yoon

Notice bibliographique

RevueComparative Biochemistry and Physiology Part A Molecular & Integrative Physiology · 2024
Typereview
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueOlfactory and Sensory Function Studies
Établissements canadiensThe Scarborough HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCentre for Environmental Research in the Anthropocene, University of Toronto Scarborough
Mots-clésOlfactory systemNeurosciencePsychologyBiologyCognitive science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

As more physiologists start to incorporate animal behavior into their experiments, especially in the olfactory behavior research field, some considerations are often overlooked, partly due to the inherited way that physiological experiments are traditionally designed and performed. Here we highlight some of these subtle but important considerations and make a case for why these might affect the results collected from behavioral assays. Our aim is to provide useful suggestions for increased standardization of methods so they can be more easily replicated among different experiments and laboratories. We have focused on areas that are less likely to be mentioned in the materials and methods section of a manuscript such as starvation, preliminary experiments, appropriate sample sizes and considerations when choosing an odorant for an assay. Additionally, we are strongly cautioning against the use of alarm cue to generate behavioral responses due to its highly unstable chemical properties/potency. Instead, we suggest using pure chemicals (made up of one known molecule) such as amino acids, bile acids, or polyamines that are commercially available and easier to make up in known concentrations. Lastly, we strongly suggest using environmentally relevant concentrations of these odorants. We believe these guidelines will help standardize these assays and improve replication of experiments within and between laboratories. • We provide considerations when performing olfactory behavioral tests. • These include using appropriate samples sizes, pure chemicals as odorants at environmentally relevant concentrations. • Avoid starving animals when testing predator odorants and avoid using alarm cue. • Use appropriate lighting and avoid air exposure of the animal when transferring from exposure tank to the behavioral arena. • These are aimed at increasing reproducibility of results in this research field.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,018
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,081
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,061
Score d'incertitude au seuil0,093

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0180,081
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,003
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0050,009
Communication savante0,0050,010
Science ouverte0,0100,005
Intégrité de la recherche0,0610,073
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0130,027

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,490
Tête enseignante GPT0,470
Écart entre enseignants0,019 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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