A sensitive assay for measuring whole-blood responses to type I IFNs
Notice bibliographique
Résumé
Human inborn errors of the type I IFN response pathway and auto-Abs neutralizing IFN-α, -β, and/or -ω can underlie severe viral illnesses. We report a simple assay for the detection of both types of condition. We stimulate whole blood from healthy individuals and patients with either inborn errors of type I IFN immunity or auto-Abs against type I IFNs with glycosylated human IFN-α2, -β, or -ω. As controls, we add a monoclonal antibody (mAb) blocking the type I IFN receptors and stimulate blood with IFN-γ (type II IFN). Of the molecules we test, IP-10 (encoded by the interferon-stimulated gene (ISG) CXCL10 ) is the molecule most strongly induced by type I and type II IFNs in the whole blood of healthy donors in an ELISA-like assay. In patients with inherited IFNAR1, IFNAR2, TYK2, or IRF9 deficiency, IP-10 is induced only by IFN-γ, whereas, in those with auto-Abs neutralizing specific type I IFNs, IP-10 is also induced by the type I IFNs not neutralized by the auto-Abs. The measurement of type I and type II IFN-dependent IP-10 induction therefore constitutes a simple procedure for detecting rare inborn errors of the type I IFN response pathway and more common auto-Abs neutralizing type I IFNs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».